More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3292 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  58.64 
 
 
294 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  45.7 
 
 
298 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  44.55 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.33 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
226 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  43.23 
 
 
294 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  51.42 
 
 
298 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  44.13 
 
 
289 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  46.7 
 
 
297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  47.58 
 
 
297 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  45.6 
 
 
297 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  43.86 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  50.71 
 
 
291 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 
241 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  41.38 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.85 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  46.95 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 
296 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 
291 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 
281 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  46.73 
 
 
295 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  42.81 
 
 
297 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  44.4 
 
 
296 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  43.1 
 
 
299 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  42.35 
 
 
296 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  42.68 
 
 
299 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  46.23 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 
398 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  47.09 
 
 
372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
454 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  44.27 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  46.67 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  41.28 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 
296 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  40.91 
 
 
281 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 
325 aa  163  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
281 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  41.63 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  45.24 
 
 
237 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  45.33 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
281 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
316 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  40.32 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  43.16 
 
 
568 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  41.18 
 
 
432 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  44.34 
 
 
410 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 
279 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  43.13 
 
 
325 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  42.01 
 
 
307 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  42.45 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  41.06 
 
 
295 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  42.45 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  43.58 
 
 
279 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  41.88 
 
 
279 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  39.73 
 
 
291 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  43.32 
 
 
404 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  42.45 
 
 
279 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  41.15 
 
 
281 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.93 
 
 
435 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  42.97 
 
 
326 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  42.97 
 
 
326 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  41.71 
 
 
325 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.93 
 
 
403 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  42.28 
 
 
326 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  42.97 
 
 
326 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  43.81 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  41.18 
 
 
406 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  44.06 
 
 
296 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  45.12 
 
 
299 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  41.71 
 
 
325 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  41.94 
 
 
332 aa  154  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  49.04 
 
 
223 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  42.45 
 
 
302 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
322 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
322 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
404 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>