More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0812 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 291 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  65.74 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  64.36 
 
 		 291 aa  353  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  63.67 
 
 		 291 aa  351  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  65.52 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  63.67 
 
 		 291 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  61.25 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  55.36 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  55.71 
 
 		 295 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  55.52 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  56.7 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  55.1 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  54.83 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  54.58 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  53.72 
 
 		 295 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  54.48 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.54 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  64.41 
 
 		 226 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  53.29 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  53.58 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  52.4 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  53.44 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  52.23 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  52.23 
 
 		 298 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  54.3 
 
 		 298 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  60.62 
 
 		 241 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  51.03 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  59.03 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  54.23 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  52.67 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  50.34 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  50.51 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  51.15 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  50.77 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  46.21 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  49.81 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.58 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.62 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.29 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  46.93 
 
 		 404 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  43.88 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  44.91 
 
 		 435 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  46.38 
 
 		 408 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  49.53 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.6 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.6 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  40.34 
 
 		 419 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  47.79 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  46.76 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.58 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.58 
 
 		 429 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 		 419 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  40.46 
 
 		 410 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  43.43 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  41.76 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  41.8 
 
 		 429 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 		 411 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  46.27 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  43.66 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.5 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  46.77 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  40.69 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  41.96 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  46.27 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.05 
 
 		 403 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.41 
 
 		 418 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  46.77 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  42.22 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  46.27 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  46.77 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  44.16 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  45.74 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.69 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  42.57 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  44.3 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  44.93 
 
 		 372 aa  156  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 454 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  48.98 
 
 		 223 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  44.28 
 
 		 568 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  42.52 
 
 		 410 aa  156  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.5 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  39.69 
 
 		 405 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.43 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>