More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1756 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 309 aa  609  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  57 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  58.59 
 
 		 325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  56.04 
 
 		 295 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  56 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  58.25 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  55.22 
 
 		 299 aa  291  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  56.38 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  55.85 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 		 299 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  55.44 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.22 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  54.7 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  52.86 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  52.19 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 297 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  52.35 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  51.52 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  52.53 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  52.17 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  56.04 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  62.56 
 
 		 226 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  51.84 
 
 		 291 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.82 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  51.35 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  55.22 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  57.92 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  52.79 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  52.85 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  56.58 
 
 		 289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  47.52 
 
 		 291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.68 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  46.41 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  47.02 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  46.51 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 419 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  48.15 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  49.07 
 
 		 429 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  49.07 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  48.53 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  41.86 
 
 		 398 aa  175  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.64 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.58 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  44.62 
 
 		 420 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  46.23 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  42.97 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  48.15 
 
 		 418 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  47.2 
 
 		 297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  44.67 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.58 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.58 
 
 		 415 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  49.06 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  47.69 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  47.56 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  45 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  48.82 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  45 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.59 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  43.78 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.68 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  44.9 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 		 435 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  48.82 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 438 aa  169  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  48.53 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  49.51 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  45.34 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  49.75 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  48.29 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  41.57 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  44.98 
 
 		 237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  44.84 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 454 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 281 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 568 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  44.87 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  43.42 
 
 		 412 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  42.79 
 
 		 407 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  45.28 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  45.83 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  45.07 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 		 411 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  46.53 
 
 		 410 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  47.32 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.28 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>