More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0687 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
317 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  52.94 
 
 
325 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  52.65 
 
 
322 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  52.25 
 
 
325 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  51.9 
 
 
325 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  52.3 
 
 
322 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  53 
 
 
322 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  52.25 
 
 
325 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  56.13 
 
 
328 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  51.24 
 
 
325 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  50.88 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  50.88 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  50.88 
 
 
326 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  51.08 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  49.82 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  54.15 
 
 
326 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  53.07 
 
 
357 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  53.1 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  44.18 
 
 
369 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  47.1 
 
 
306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  51.98 
 
 
335 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  52.61 
 
 
326 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  49.58 
 
 
328 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  54.23 
 
 
330 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 
326 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  49.35 
 
 
326 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  52.38 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 
330 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  45.64 
 
 
404 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.96 
 
 
404 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  48.48 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  51.9 
 
 
331 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  50.94 
 
 
348 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 
330 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  48.26 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.87 
 
 
398 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  39.04 
 
 
410 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  46.28 
 
 
411 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  45.76 
 
 
413 aa  210  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  46.31 
 
 
438 aa  208  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.04 
 
 
408 aa  208  8e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  50.24 
 
 
316 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  39.33 
 
 
412 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 
410 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  52.97 
 
 
327 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  45.23 
 
 
406 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  44.17 
 
 
405 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.15 
 
 
429 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 
405 aa  202  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  46.64 
 
 
405 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.06 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 
398 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  44.3 
 
 
429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.88 
 
 
404 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.57 
 
 
418 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  42.68 
 
 
404 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 
279 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  39.58 
 
 
419 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.57 
 
 
418 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.67 
 
 
410 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  45.13 
 
 
407 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  49.02 
 
 
432 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  43.88 
 
 
404 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 
404 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.75 
 
 
276 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  37.71 
 
 
429 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  46.19 
 
 
302 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 
415 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 
404 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  42.62 
 
 
404 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  45.77 
 
 
400 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  42.53 
 
 
280 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
240 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 
411 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  48.29 
 
 
237 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.87 
 
 
281 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.18 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.34 
 
 
406 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.21 
 
 
284 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.7 
 
 
278 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  43.24 
 
 
409 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  46.83 
 
 
419 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  42.8 
 
 
310 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  46.34 
 
 
403 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  46.34 
 
 
215 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  38.95 
 
 
400 aa  176  4e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>