65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1975 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1975  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211105 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  33.5 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.95 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  27.94 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  25.74 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.35 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  31 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  31 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3230  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.829076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.11 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0128  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.49 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.49 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  21.24 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29407  predicted protein  25.5 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160817  normal  0.108947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.67 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  25.84 
 
 		 291 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.26 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 229 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.57 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1741  HAD superfamily hydrolase  26.8 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.985447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.52 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  23.58 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  26.17 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.68 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3340  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000100356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  26.56 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.39 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  24.51 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  25.94 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  23.71 
 
 		 272 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  30.19 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  23.11 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.5 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  22 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.9 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  34.86 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 218 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  32.32 
 
 		 224 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 215 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  23.2 
 
 		 272 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.69 
 
 		 234 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  22.97 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>