118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5602 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5602  AgaE protein, conversion of agropinic acid to mannopinic acid  100 
 
 		 134 aa  274  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592638  hitchhiker  0.00552874 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  43.55 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 442 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  46.77 
 
 		 447 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 447 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 447 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 451 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 446 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 442 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 430 aa  104  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  35.2 
 
 		 460 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  37.6 
 
 		 443 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  38.52 
 
 		 446 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  37.9 
 
 		 445 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 441 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 431 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 430 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 446 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 442 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 442 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 441 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 		 431 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 430 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 430 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 441 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 441 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 441 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 441 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 441 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 441 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 441 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  36.89 
 
 		 441 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 444 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 439 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 443 aa  91.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 442 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 		 441 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 441 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 441 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  35.25 
 
 		 466 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 442 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 441 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 445 aa  88.2  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  33.88 
 
 		 436 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  33.61 
 
 		 441 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 444 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 446 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 455 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 444 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  31.45 
 
 		 443 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.93 
 
 		 444 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 		 428 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 433 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 394 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 389 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 396 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  33.05 
 
 		 389 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  34.62 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 378 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 423 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 385 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 389 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 394 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 382 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 382 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 		 384 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.81 
 
 		 384 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 392 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 		 376 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  30 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 391 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 390 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  23.97 
 
 		 390 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 407 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  37.5 
 
 		 375 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 393 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.51 
 
 		 385 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  30.49 
 
 		 377 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 383 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 983 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 387 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>