More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4773 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4773  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.164682 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4823  dihydrodipicolinate synthetase  90.17 
 
 		 295 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0718726  normal  0.342199 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  32.56 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  31.42 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.71 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  29.25 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  32.47 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 298 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  30.14 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.78 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  29.58 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.73 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.85 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.9 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1251  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.15 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21211  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.26 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  26.3 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  29.21 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>