164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3436 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 464 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.91 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0949  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 457 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000456449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13170  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 423 aa  309  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0943  FAD dependent oxidoreductase  39 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  37.22 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  36.89 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  36.06 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  37.75 
 
 		 435 aa  256  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  40.82 
 
 		 475 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1475  hypothetical protein  40.3 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2126  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  34.84 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  32.66 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5110  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0801597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4522  FAD dependent oxidoreductase  37.36 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.682037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0358  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8047  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0569  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  35.62 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.413565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0951  hypothetical protein  30.85 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000261161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3248  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3652  hypothetical protein  32.87 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1335  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 446 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  33.02 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00733964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3311  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3278  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0393612  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3752  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  32.78 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  28.77 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1170  hypothetical protein  35.45 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2584  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1081  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.18 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  30.43 
 
 		 491 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3505  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0476433  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4868  invasion protein IbeA  30.13 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.720893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  31.33 
 
 		 624 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2295  glucose-inhibited division protein A  31.04 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  29.78 
 
 		 672 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0878  hypothetical protein  29.51 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1630  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 		 421 aa  130  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3674  membrane protein  31.46 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0163  hypothetical protein  24.84 
 
 		 459 aa  126  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  26.46 
 
 		 600 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3215  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 		 483 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0712  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0113421  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0117  HI0933 family protein  28 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.19867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  30.08 
 
 		 606 aa  113  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  26.23 
 
 		 757 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3216  FAD dependent oxidoreductase  30.31 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000545422  normal  0.274054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26 
 
 		 764 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  24.74 
 
 		 764 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.29 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  24.24 
 
 		 618 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  24.89 
 
 		 758 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  25.79 
 
 		 797 aa  96.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.62 
 
 		 600 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  27.87 
 
 		 761 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6391  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  26.79 
 
 		 748 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6222  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  31.1 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6624  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.678133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.36 
 
 		 722 aa  76.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  31.93 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  26.26 
 
 		 599 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  30.92 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2340  hypothetical protein  31.91 
 
 		 763 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  21.57 
 
 		 514 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  32.14 
 
 		 582 aa  67  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  32.05 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4711  secreted protein-putative xanthan lyase related  31.45 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2922  hypothetical protein  22.37 
 
 		 625 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  30.2 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1531  hypothetical protein  27.74 
 
 		 784 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.880876  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  25.32 
 
 		 543 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  40.54 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  40.54 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  27.71 
 
 		 668 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  28 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  21.7 
 
 		 527 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  29.93 
 
 		 595 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 538 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  29.93 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.98 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  25.57 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  25.68 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  31.3 
 
 		 532 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3567  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  57.78 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.593485  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 537 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  33.68 
 
 		 521 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2103  hypothetical protein  27.86 
 
 		 583 aa  50.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.469533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 534 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2669  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  25.37 
 
 		 601 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  26.53 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  68.57 
 
 		 351 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.289522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1699  secreted protein-putative xanthan lyase related  30.77 
 
 		 550 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112784  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  32.17 
 
 		 660 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.12 
 
 		 646 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>