106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2350 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  82.76 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  46.64 
 
 		 305 aa  201  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4320  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400643  normal  0.300736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0145  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.818844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  37.9 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.96 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 292 aa  108  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2898  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1932  AraC family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  36.93 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0111  AraC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.73 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  33.84 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.28 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.84 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  30.05 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  31.64 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  29.53 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.16 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0509  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.91 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.591495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  30.41 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.61 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  24.07 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  23.26 
 
 		 272 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.44 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  22.57 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1886  transcriptional regulator, AraC family  23.12 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.979359  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  22.13 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  22.45 
 
 		 271 aa  52  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  21.4 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  23.67 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1507  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  39.76 
 
 		 504 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  28.65 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  21.67 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  28.02 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0827  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  32.53 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1508  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 497 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000668413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2088  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0587  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  32.53 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000113991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2176  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1545  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  32.53 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2059  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  32.53 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0739  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  32.53 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480247  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.25 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.12 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  25.61 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3824  transcriptional regulator, AraC family  19.84 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  31.61 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  34.25 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  19.41 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2581  Helix-turn-helix, AraC domain protein  36.23 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.012517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>