More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2176 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2176  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.187611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2088  AraC family transcriptional regulator  99.1 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0739  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  99.1 
 
 
221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.480247  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1545  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  98.64 
 
 
252 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2059  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  98.64 
 
 
252 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0827  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  96.83 
 
 
252 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0781437  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0587  type III secretion system transcriptional regulator BsaN  100 
 
 
208 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0000113991  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3209  invasion protein  35.21 
 
 
249 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3104  invasion protein  35.21 
 
 
249 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000120777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3089  invasion protein  35.21 
 
 
249 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3021  invasion protein  35.21 
 
 
249 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3052  invasion protein  36.56 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.227762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4150  EivF  34.29 
 
 
249 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0288495 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0178  transcriptional regulator MxiE  40.16 
 
 
210 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0571394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 
322 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 
291 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 
288 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.74 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
319 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 
320 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  21.65 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 
318 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 
299 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 
299 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  28.42 
 
 
300 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
293 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 
309 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  33.7 
 
 
316 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2484  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
128 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2387  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
128 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000368739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 
287 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  31.07 
 
 
335 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 
1201 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3711  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2466  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 
313 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 
301 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 
517 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
326 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
388 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  33.93 
 
 
517 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
300 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 
326 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 
300 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  25 
 
 
347 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 
271 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 
292 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
285 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
332 aa  52  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
292 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
332 aa  52  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3290  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
324 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
291 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 
285 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 
291 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 
427 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  37.35 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  28.42 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  28.42 
 
 
301 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.63 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2833  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360969  hitchhiker  0.00326998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
383 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  32.47 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
303 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 
258 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
154 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  27.21 
 
 
286 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 
273 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4941  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 
276 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
288 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 
325 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
340 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 
351 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
164 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
287 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>