More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0620 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 263 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  67.68 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  65.27 
 
 		 268 aa  364  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  63.12 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  65.4 
 
 		 264 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  63.5 
 
 		 272 aa  349  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  59.54 
 
 		 267 aa  344  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  59.16 
 
 		 267 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  59.92 
 
 		 268 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  56.44 
 
 		 288 aa  315  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  56.23 
 
 		 276 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  52.85 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  52.85 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  49.81 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  53.23 
 
 		 266 aa  295  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  53.21 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.61 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  53.23 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  51.91 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  55.3 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  55.3 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  55.3 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  47.91 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  41.33 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  244  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  47.66 
 
 		 281 aa  240  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  43.35 
 
 		 267 aa  238  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  47.51 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 303 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.34 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 387 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.34 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  27.45 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.24 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.98 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.98 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.88 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.23 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.17 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  23.85 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  28.14 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.28 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  23.33 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  22.57 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  22.59 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.51 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.61 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  22.54 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  23.39 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.49 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  23.74 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  23.77 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  24.35 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  24.42 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>