More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0314 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  97.54 
 
 
244 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  67.62 
 
 
244 aa  348  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  64.34 
 
 
241 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  49.38 
 
 
239 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1087  flagellar basal body rod protein FlgF  47.3 
 
 
243 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2810  flagellar basal body rod protein  44.03 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.170065  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  45.57 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1656  flagellar basal body rod protein  45.27 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.755321 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  45.15 
 
 
243 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0119  flagellar basal body rod protein FlgF  45.15 
 
 
243 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  45.27 
 
 
244 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0655  flagellar basal body rod protein  44.21 
 
 
242 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.486517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0681  flagellar basal body rod protein  43.39 
 
 
242 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0692  flagellar basal body rod protein  43.39 
 
 
242 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0719019  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  45.08 
 
 
242 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1709  flagellar basal body rod protein  40.73 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  35.48 
 
 
245 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3251  flagellar basal body rod protein FlgF  36.1 
 
 
238 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  36.09 
 
 
244 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  31.58 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.77 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  33.07 
 
 
248 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  35.04 
 
 
244 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4194  flagellar basal body rod protein FlgF  34.3 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  34.01 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  32.79 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  33.46 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  34.84 
 
 
239 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  34.43 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  34.89 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  33.2 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0822  flagellar basal body rod protein FlgF  34.41 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.743274  hitchhiker  0.00942919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  33.61 
 
 
239 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  33.33 
 
 
253 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  33.19 
 
 
238 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3282  flagellar basal body rod protein  32.68 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  36.96 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  34.4 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  35.46 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1507  flagellar basal body rod protein FlgF  33.98 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  33.74 
 
 
238 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  34.27 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3272  flagellar basal body rod protein FlgF  32.52 
 
 
246 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3246  flagellar basal body rod protein FlgF  33.06 
 
 
246 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28847  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  29.64 
 
 
255 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3048  flagellar basal body rod protein FlgF  32.93 
 
 
246 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  34.3 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  30.22 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4422  flagellar basal body rod protein FlgF  31.94 
 
 
253 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  32.81 
 
 
254 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1122  flagellar basal body rod protein FlgF  28.74 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.8 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  32.1 
 
 
267 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.81 
 
 
265 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0398  hypothetical protein  30.56 
 
 
249 aa  105  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.36918  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  29.87 
 
 
247 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.54 
 
 
259 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  31.75 
 
 
244 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  32.02 
 
 
251 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  31.13 
 
 
255 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  31.35 
 
 
244 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3718  flagellar basal-body rod FlgF  32.1 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.97 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0565  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.86 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2263  hypothetical protein  29.96 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.49 
 
 
244 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  29.96 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  30.59 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  29.96 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  30.15 
 
 
261 aa  92  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1104  flagellar basal body rod protein  33.98 
 
 
276 aa  92  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  29.32 
 
 
246 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3646  flagellar basal-body rod FlgG  28.63 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.26 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2505  flagellar basal body rod protein  33.33 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0291035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  27.6 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.43 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  29.2 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1229  flagellar basal body rod protein FlgG  29.2 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  30.36 
 
 
243 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  28.95 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2834  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.21 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4425  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.95 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.09 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.09 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3105  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.65 
 
 
260 aa  89  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0444058  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3832  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.65 
 
 
260 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.405725  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  30.2 
 
 
248 aa  89  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3069  flagellar basal body and hook protein  30.96 
 
 
242 aa  88.6  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2601  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.88 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.276057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1352  flagellar basal body rod protein  32.88 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.92 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  33.6 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.37 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0295  flagellar basal body rod protein FlgG  30.74 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0271  flagellar basal body rod protein FlgG  27.68 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3330  flagellar basal body rod protein FlgG  27.68 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0467  flagellar basal body rod protein FlgG  27.68 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0283  flagellar basal body rod protein FlgG  27.68 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>