More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1541 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  33.57 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.66 
 
 		 145 aa  84.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  37.59 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  34.27 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  36.36 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  36.36 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  36.36 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  36.36 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  36.88 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.86 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  35.66 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  36.88 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  36.88 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  35.66 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  34.51 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.24 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.67 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.72 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  32.17 
 
 		 147 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  34.97 
 
 		 144 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.18 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  36.88 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 145 aa  72  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.64 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.5 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.51 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36.88 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  36.81 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  39.72 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.53 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.95 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  34.27 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.1 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  31.87 
 
 		 291 aa  67  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  34.97 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  30.34 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  32.41 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.79 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 449 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  32.41 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.28 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  34.69 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.86 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.79 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  30.5 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  39.86 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  32.9 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.58 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  35.33 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  33.1 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.52 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  32.19 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.51 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  30.99 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  34.04 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>