More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0320 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 267 aa  547  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  48.65 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  46.78 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  41.01 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.36 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 250 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 337 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  35.45 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.45 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  33.19 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  31.61 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  29.52 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  32.18 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.59 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>