More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6270 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 436 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  72.07 
 
 		 435 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  59.86 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  55.35 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  58.67 
 
 		 430 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  58.67 
 
 		 432 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  56.98 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  57.72 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  51.97 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  52.71 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  47.16 
 
 		 431 aa  362  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  44.58 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  41.67 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  41.42 
 
 		 427 aa  273  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  40.44 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  40.49 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 427 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  39.49 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  37.92 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 		 427 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 428 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 436 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  41.22 
 
 		 427 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  40.49 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 440 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  35.9 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 478 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  38.7 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  37.31 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  30.95 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  33.1 
 
 		 427 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  32.62 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.57 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  30.72 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.82 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.86 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 433 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.86 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 445 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.86 
 
 		 427 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 442 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  32.24 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  33.64 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.45 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>