146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3800 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3800  amidohydrolase 2  100 
 
 
281 aa  564  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4079  amidohydrolase 2  43.27 
 
 
266 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.357402  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
306 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  42.28 
 
 
306 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  46.44 
 
 
304 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  41.13 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  41.49 
 
 
295 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0723  amidohydrolase 2  41.74 
 
 
272 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  43.16 
 
 
302 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  40.08 
 
 
277 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  40.73 
 
 
280 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  41.02 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  40.32 
 
 
281 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  39.33 
 
 
284 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  39.53 
 
 
308 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1252  amidohydrolase 2  39.57 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.06039 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  39.76 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  39.76 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  39.76 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  39.76 
 
 
368 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  39.76 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  39.76 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  39.76 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  39.42 
 
 
303 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  41.39 
 
 
298 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  42.46 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  42.13 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  34.95 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  40.32 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  40.73 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  40.32 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  40.32 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  40.32 
 
 
296 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  40.32 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  36.1 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  34.41 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  40.24 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  38.55 
 
 
291 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  34.16 
 
 
312 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  34.4 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  37.7 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  38.79 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  33.45 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  36.89 
 
 
302 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  39.75 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  34.5 
 
 
296 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  34.44 
 
 
290 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  35.95 
 
 
290 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  37.04 
 
 
312 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  34.3 
 
 
315 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  36.48 
 
 
304 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  35.25 
 
 
296 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
310 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
310 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  36.48 
 
 
312 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  36.07 
 
 
313 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  37.7 
 
 
304 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  36.48 
 
 
304 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
310 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  36.84 
 
 
327 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  36.51 
 
 
271 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  35.27 
 
 
302 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  32.73 
 
 
312 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  32.16 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
273 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  33.89 
 
 
310 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  34.27 
 
 
314 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
274 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
293 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
293 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  32.86 
 
 
293 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  34.75 
 
 
287 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  33.6 
 
 
302 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  35.55 
 
 
296 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  36.63 
 
 
295 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  32.9 
 
 
320 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  34.01 
 
 
289 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  34.01 
 
 
275 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  33.6 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  35.17 
 
 
287 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  31.32 
 
 
289 aa  99  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  33.8 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  30.56 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  35.12 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  34.04 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  32.13 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  33.09 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0660  hypothetical protein  25.26 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0270681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  33.62 
 
 
286 aa  95.5  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  33.88 
 
 
302 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0581  hypothetical protein  24.57 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  33.05 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  27.21 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  35.74 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  32.65 
 
 
318 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  34.2 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  44.06 
 
 
198 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  44.06 
 
 
198 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>