More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3593 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  58.84 
 
 		 326 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  54.27 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0962  hypothetical protein  57.01 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4890  hypothetical protein  56.86 
 
 		 330 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.979482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  52 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  49.09 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.64 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  39.69 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 326 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  39.81 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.57 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.45 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  39.14 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.01 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.27 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.36 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.53 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.85 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.73 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.89 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  36.31 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.87 
 
 		 333 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.8 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.59 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.89 
 
 		 332 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  37.46 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  37.69 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.08 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.54 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  36.56 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38.04 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  41.33 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.45 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  39.87 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.47 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  41.19 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  37.82 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.25 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  39.14 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  37.16 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  39.02 
 
 		 336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.67 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.4 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.54 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  38.64 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.2 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.79 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  39.01 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.16 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.96 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.73 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  39.02 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  39.93 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  36.88 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.21 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.76 
 
 		 328 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  40.73 
 
 		 323 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  41.75 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.14 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  39.86 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  39.57 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.76 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.96 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  38.79 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  39.46 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.71 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.449254  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.49 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  38.74 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  36.97 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.48 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.24 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  37.61 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  39.67 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  39.4 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  36.17 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  37.69 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.39 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.67 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.84 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.21 
 
 		 330 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.09 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>