158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1220 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1220  transport-associated protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0189  hypothetical protein  56.07 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4429  transport-associated  56.34 
 
 		 215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4562  transport-associated  56.34 
 
 		 215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.266043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6189  transport-associated  56.34 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551844  normal  0.435123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1870  periplasmic phospholipid binding protein  59.62 
 
 		 216 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5912  transport-associated protein  56.34 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203256  normal  0.355197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1108  transport-associated  57.75 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0390  transport-associated  52.09 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1111  transport-associated  54.42 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  52.56 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  49.54 
 
 		 216 aa  198  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1226  transport-associated protein  47.22 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1151  transport-associated protein  79.53 
 
 		 141 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0353  phospholipid binding protein  53.95 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5578  transport-associated  50.23 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00026661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5562  transport-associated  56.34 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5544  transport-associated  48.29 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.078197  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  52.09 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1892  putative phophoslipid binding protein  50.23 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2622  transport-associated  49.77 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0186  hypothetical protein  47.89 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.117611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4432  transport-associated  48.36 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4565  transport-associated  48.36 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2264  transport-associated  44.39 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1063  OsmY domain-containing protein  49.3 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0116  OsmY domain-containing protein  49.3 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.567152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1101  transport-associated  44.13 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1280  OsmY domain-containing protein  49.3 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2802  putative phospholipid-binding protein  49.3 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2660  putative phospholipid-binding protein  49.3 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0140  putative phospholipid-binding protein  49.3 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4234  transport-associated  47.34 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.855371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0204  hypothetical protein  42.72 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3808  transport-associated  45.83 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0414  OsmY domain-containing protein  48.61 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0431  transport-associated  49.06 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3604  hypothetical protein  43.4 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.984998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  55.4 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  55.4 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  55.4 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  55.4 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  55.4 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2881  transport-associated  49.28 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1868  transport-associated  44.81 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.882392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1909  transport-associated  47.2 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1491  transport-associated  44.6 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3328  transport-associated  46.67 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.686073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1899  periplasmic phospholipid binding protein  47.09 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1664  hypothetical protein  42.06 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0800901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3859  transport-associated protein  44.13 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7765  Smc22-1 ( osmotically inducible sensory protein)  44.02 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.17558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7783  putative osmotically-inducible protein Y (precursor)  40.93 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.379132  normal  0.155349 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  44.19 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0417  transport-associated  48.8 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2606  transport-associated  49.28 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0213477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2613  transport-associated  44.6 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3886  transport-associated  45.07 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121  normal  0.085803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2456  transport-associated  41.23 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262468  normal  0.570841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0425  transport-associated  43.19 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.379914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5879  transport-associated protein  42.79 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  54.92 
 
 		 197 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0453  OsmY domain-containing protein  54.92 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584382  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6209  transport-associated  42.79 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6897  transport-associated  41.71 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7784  putative osmotically inducible protein Y precursor  43.52 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602659  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3634  transport-associated  41.9 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4061  transport-associated  42.65 
 
 		 213 aa  121  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221026  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6133  transport-associated  42.86 
 
 		 178 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6056  transport-associated  39.67 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.822447  hitchhiker  0.00012166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2956  transport-associated protein  31.75 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7774  hypothetical protein  26.42 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.194796  normal  0.37862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  31.28 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  25.11 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  29.67 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  30 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3008  transport-associated  43.28 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.845377  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1214  transport-associated  50 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0393886  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3809  transport-associated  52.24 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.810583  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3502  transport-associated  50.75 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  26.13 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2676  hypothetical protein  45.21 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  33.33 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  34.09 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1333  transport-associated  45.71 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.286279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.58 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  25.81 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2827  transport-associated  43.75 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  32.52 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3925  putative phophoslipid binding protein  30.92 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.679907  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2077  transport-associated  27.41 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.735501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5271  transport-associated  44.12 
 
 		 86 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.833634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3903  transport-associated  43.06 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0263909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  34.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  34.88 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  34.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  34.68 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  31.87 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  31.62 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2836  transport-associated  34.75 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>