More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1365 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  100 
 
 		 487 aa  936    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  88.2 
 
 		 485 aa  799    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  87.6 
 
 		 485 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  71.09 
 
 		 508 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
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NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  69.85 
 
 		 493 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.45 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.28 
 
 		 496 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  53.99 
 
 		 498 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  53.22 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.12 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.93 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  37.45 
 
 		 523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.07 
 
 		 537 aa  297  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.53 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 		 531 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.22 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 510 aa  183  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 515 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 		 529 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.7 
 
 		 482 aa  180  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 529 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.48 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 545 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 532 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 		 635 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 479 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.6 
 
 		 479 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 579 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  30.35 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.61 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.8 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 		 521 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  29.88 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 496 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
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NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 523 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 523 aa  170  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.43 
 
 		 564 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 517 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.89 
 
 		 520 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
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NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.88 
 
 		 537 aa  169  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.52 
 
 		 514 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.16 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.92 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 528 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 570 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 483 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 511 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0985  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.59 
 
 		 501 aa  166  9e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000298388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 		 509 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.68 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.06 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.503144  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.21 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.92 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.59 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  27.21 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  27.21 
 
 		 492 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 511 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 519 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.75 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.25 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.72 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.55 
 
 		 519 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
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