More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1920 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  71.03 
 
 		 214 aa  323  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  72.12 
 
 		 214 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  70.53 
 
 		 213 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  68.6 
 
 		 216 aa  308  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  67.15 
 
 		 220 aa  308  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  67.45 
 
 		 230 aa  301  7.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.76 
 
 		 213 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  63.11 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  58.65 
 
 		 223 aa  271  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  60.95 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  60.87 
 
 		 214 aa  268  8e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  60.98 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  60.98 
 
 		 221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  52.86 
 
 		 213 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  52.53 
 
 		 217 aa  244  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  54.29 
 
 		 213 aa  244  8e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.07 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  51.22 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  51.69 
 
 		 213 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  60.11 
 
 		 208 aa  228  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  50.47 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.74 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  52.17 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  49.76 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  56.5 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  53.08 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  52.09 
 
 		 221 aa  221  8e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  50.93 
 
 		 215 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  50.93 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.14 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  46.05 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  52.4 
 
 		 215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.08 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  51.42 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.17 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  48.6 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  47 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  46.54 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  47.42 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  50.26 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.36 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  46.79 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  46.23 
 
 		 216 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  49.48 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  48.45 
 
 		 212 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.97 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.54 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  45.37 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  47.34 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  45.77 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  45.58 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  44.81 
 
 		 224 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.63 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.4 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  45.93 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  48.44 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  43.13 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  42.92 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  44.34 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  42.45 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  44.98 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  44.98 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  44.5 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  43.93 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  42 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  43.37 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  47.28 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  40.85 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  41.79 
 
 		 212 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  40.8 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  41.29 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  40.38 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  46.02 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  41.29 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  39.34 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  40.58 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  46.02 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.2 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  41.83 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  39.5 
 
 		 211 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  38 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  40.8 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  44.44 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  42.11 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  41.5 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  41.43 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.8 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  41.29 
 
 		 212 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  40.3 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  40 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  42.05 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  41.24 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  41.62 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  41.62 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.18 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.18 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.62 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  38.5 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>