More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1965 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  100 
 
 
225 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  92.83 
 
 
223 aa  440  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  84.38 
 
 
224 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  82.14 
 
 
224 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  80.8 
 
 
225 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  79 
 
 
221 aa  371  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  70.19 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  67.77 
 
 
220 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  64.02 
 
 
216 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  62.86 
 
 
213 aa  304  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  64.42 
 
 
215 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  59.35 
 
 
215 aa  292  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  59.43 
 
 
215 aa  291  7e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  61.61 
 
 
212 aa  291  8e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  62.56 
 
 
213 aa  290  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.13 
 
 
225 aa  289  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  61.4 
 
 
221 aa  288  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  61.79 
 
 
212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  58.72 
 
 
223 aa  278  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  59.26 
 
 
226 aa  271  6e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.42 
 
 
220 aa  271  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  53.42 
 
 
225 aa  270  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  56.74 
 
 
215 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.01 
 
 
216 aa  261  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  56.48 
 
 
213 aa  257  8e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  55.96 
 
 
217 aa  254  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  56.42 
 
 
217 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.72 
 
 
224 aa  254  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  55.5 
 
 
217 aa  249  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  55.5 
 
 
217 aa  249  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  54.84 
 
 
217 aa  248  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.21 
 
 
215 aa  241  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  50.48 
 
 
230 aa  236  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  50.24 
 
 
232 aa  234  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.39 
 
 
213 aa  207  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  50 
 
 
219 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.17 
 
 
213 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  47.64 
 
 
220 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  48.34 
 
 
214 aa  201  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  46.48 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.23 
 
 
213 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  47.64 
 
 
213 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  45.75 
 
 
214 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  43.58 
 
 
229 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  44.95 
 
 
228 aa  191  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  44.55 
 
 
240 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  43.19 
 
 
223 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  45.12 
 
 
216 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  42.66 
 
 
226 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  45.28 
 
 
230 aa  185  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  43.58 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  40.85 
 
 
241 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  49.4 
 
 
232 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.88 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.38 
 
 
213 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  40.39 
 
 
215 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  44.5 
 
 
212 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.65 
 
 
212 aa  157  8e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  39.64 
 
 
221 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.75 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.75 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  41.4 
 
 
215 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.18 
 
 
221 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.36 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.36 
 
 
211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  35.32 
 
 
234 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  41.23 
 
 
212 aa  154  7e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.35 
 
 
212 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  45.03 
 
 
208 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  43.39 
 
 
208 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.93 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.62 
 
 
217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  42.93 
 
 
212 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  45.51 
 
 
212 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.93 
 
 
209 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  42.93 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  42.93 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  42.93 
 
 
212 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  42.19 
 
 
211 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  42.86 
 
 
213 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  43.46 
 
 
212 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.35 
 
 
212 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.15 
 
 
217 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  42.41 
 
 
212 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  43.75 
 
 
212 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  40.28 
 
 
217 aa  148  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  39.61 
 
 
213 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  42.93 
 
 
211 aa  148  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.88 
 
 
212 aa  148  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.88 
 
 
212 aa  148  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.31 
 
 
212 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  39.61 
 
 
212 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>