More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3741 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  61.95 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  60.29 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  60.29 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  55.66 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.28 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.5 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  54.24 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  56.5 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  51.3 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  51.1 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  51.41 
 
 		 216 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  46.8 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  51.34 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  47.74 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  49.45 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  43.94 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.52 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  47.64 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  43.93 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  50.85 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  49.43 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.9 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  44.51 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  48 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.41 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  45.21 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  42.93 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  45.74 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  46.81 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.17 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  39.79 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  43.58 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  38.54 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  40.43 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  40.76 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.51 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  42.33 
 
 		 209 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  40.69 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  42.55 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  41.49 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.49 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.71 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.8 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  40.69 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  41.01 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  42.08 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.7 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  42.08 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  42.62 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  42.08 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  42.46 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  42.46 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  43.09 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.34 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  42.08 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.34 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.94 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  40.98 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  43.37 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  40.2 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41.94 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  40.96 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  43.58 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  41.53 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  41.9 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  41.9 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.9 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  41.34 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.34 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  41.9 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  42.46 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  40.22 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  41.18 
 
 		 211 aa  158  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  40.22 
 
 		 212 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  43.02 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  40.78 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  41.9 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  39.66 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  41.9 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  41.94 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  42.94 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  41.62 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  41.21 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  41.24 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  39.11 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  42.46 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  39.89 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  39.68 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  38.28 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  41.8 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  38.12 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  40.22 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  37.82 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>