More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2522 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  100 
 
 		 230 aa  476  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  72.04 
 
 		 213 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  71.84 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  69.67 
 
 		 220 aa  317  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  68.25 
 
 		 216 aa  316  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  69.81 
 
 		 214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  67.96 
 
 		 241 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  73.17 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  62.26 
 
 		 214 aa  287  9e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  61.24 
 
 		 219 aa  285  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  60.19 
 
 		 223 aa  275  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.17 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  52.61 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  52.61 
 
 		 213 aa  249  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  51.66 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  54.55 
 
 		 217 aa  248  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  51.61 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  53.27 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  52.09 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  54.63 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  50.92 
 
 		 229 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  52.63 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  53.52 
 
 		 212 aa  229  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  50.24 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  51.6 
 
 		 221 aa  225  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  51.64 
 
 		 212 aa  222  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  50.74 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  56.35 
 
 		 208 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.91 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.98 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.55 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.89 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  49.06 
 
 		 215 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.23 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  49.06 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  46.82 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  50.96 
 
 		 212 aa  208  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  50 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  47.71 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  51.34 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.39 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.87 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  48.56 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  48.61 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  48.8 
 
 		 213 aa  202  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  49.29 
 
 		 213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.89 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  46.76 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.31 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  51.18 
 
 		 217 aa  196  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  47.64 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.83 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  43.52 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  46.08 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  43.72 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  43.56 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  45.28 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  47.78 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  44.86 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  44.6 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  44.65 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  45.19 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  44.98 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  42.79 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  45.19 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  40.76 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  44.39 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  45.12 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  44.65 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  44.65 
 
 		 217 aa  175  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  44.34 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.56 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.5 
 
 		 212 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  43.3 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.85 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  44.93 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  43.81 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  43.93 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  46.39 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  43.3 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  43.3 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  44.55 
 
 		 217 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  43.59 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  42.27 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  43.5 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  42.27 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  42.27 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  44.33 
 
 		 213 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  42.27 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  42.78 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  43.85 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.3 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  42.78 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  42.78 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.81 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>