More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5194 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  80.57 
 
 		 211 aa  358  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  78.2 
 
 		 211 aa  347  9e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  76.67 
 
 		 212 aa  338  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  75.36 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  72.04 
 
 		 211 aa  328  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  71.7 
 
 		 212 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  71.7 
 
 		 212 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  71.23 
 
 		 212 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  70.75 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  70.75 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  70.75 
 
 		 212 aa  322  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  70.75 
 
 		 212 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  69.81 
 
 		 212 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  69.81 
 
 		 212 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  69.81 
 
 		 212 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  69.81 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  68.4 
 
 		 212 aa  314  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  68.87 
 
 		 212 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  68.4 
 
 		 212 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  69.67 
 
 		 214 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  67.45 
 
 		 212 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  67.45 
 
 		 212 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  69.67 
 
 		 213 aa  310  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  66.98 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  66.98 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  67.45 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  66.98 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  67.45 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  66.98 
 
 		 212 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  66.98 
 
 		 213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  66.98 
 
 		 212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  67.77 
 
 		 211 aa  308  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  66.98 
 
 		 212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  65.88 
 
 		 211 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  65.88 
 
 		 211 aa  305  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  66.51 
 
 		 212 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  66.98 
 
 		 212 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  66.51 
 
 		 212 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  65.88 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  65.57 
 
 		 212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  65.71 
 
 		 217 aa  296  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  63.68 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  64.11 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  65.89 
 
 		 216 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  63.64 
 
 		 212 aa  291  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  64.15 
 
 		 212 aa  291  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  63.51 
 
 		 213 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  63.51 
 
 		 213 aa  287  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  63.21 
 
 		 212 aa  285  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  63.21 
 
 		 212 aa  285  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  62.91 
 
 		 213 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  61.79 
 
 		 212 aa  284  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  64.15 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  61.9 
 
 		 213 aa  281  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  61.14 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  57.14 
 
 		 218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  56.68 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  59.72 
 
 		 212 aa  268  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  60.77 
 
 		 208 aa  268  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  61.72 
 
 		 213 aa  268  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  60 
 
 		 210 aa  268  5e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  58.1 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  56.68 
 
 		 217 aa  267  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  57.87 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  57.14 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  59.17 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  56.8 
 
 		 208 aa  264  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  56.8 
 
 		 209 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  60.78 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  57.34 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  56.62 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  58.72 
 
 		 219 aa  258  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.88 
 
 		 219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  56.88 
 
 		 220 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  61.14 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  56.88 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  55.29 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.05 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  57.28 
 
 		 209 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.25 
 
 		 219 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  55.34 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  54.79 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  53.18 
 
 		 220 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  54.9 
 
 		 213 aa  247  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  54.79 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  52.29 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  57.28 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  55.66 
 
 		 256 aa  234  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  52.07 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  53.88 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  52.63 
 
 		 233 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2756  peroxidase  52.75 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  48.62 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>