More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1436 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  83.1 
 
 		 212 aa  374  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  83.57 
 
 		 212 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  69.01 
 
 		 213 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  68.1 
 
 		 211 aa  311  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  65.71 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  64.79 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  65.71 
 
 		 212 aa  299  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  67.59 
 
 		 216 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  66.19 
 
 		 212 aa  298  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  67.14 
 
 		 211 aa  299  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  64.76 
 
 		 211 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  64.76 
 
 		 211 aa  295  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  65.71 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  62.91 
 
 		 213 aa  294  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  63.81 
 
 		 212 aa  294  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  64.76 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  63.85 
 
 		 213 aa  293  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  64.29 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  63.33 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  64.29 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  63.81 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  64.29 
 
 		 212 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  63.81 
 
 		 212 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  63.81 
 
 		 212 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  63.81 
 
 		 212 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  61.43 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  61.43 
 
 		 212 aa  290  9e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  64.29 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  63.33 
 
 		 212 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  62.86 
 
 		 212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  63.68 
 
 		 213 aa  287  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  62.86 
 
 		 212 aa  287  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  65.26 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  62.38 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  60.56 
 
 		 214 aa  285  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  62.38 
 
 		 212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  63.81 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  62.86 
 
 		 212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  61.9 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  61.9 
 
 		 212 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  62.38 
 
 		 212 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  61.9 
 
 		 211 aa  281  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  61.43 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  61.43 
 
 		 212 aa  280  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  61.43 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  63.81 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  60.95 
 
 		 212 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  61.43 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  62.56 
 
 		 212 aa  278  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  62.38 
 
 		 212 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  61.9 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  61.43 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  62.38 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  62.98 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  60.38 
 
 		 212 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  60.58 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  63.55 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  63.46 
 
 		 208 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  60.49 
 
 		 208 aa  266  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  58.85 
 
 		 215 aa  265  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  57.87 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  58.06 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  59.51 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  56.94 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  58.05 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  57.62 
 
 		 212 aa  254  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  56.22 
 
 		 218 aa  254  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  56.48 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  59.02 
 
 		 209 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  56.94 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  54.81 
 
 		 213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  55.96 
 
 		 219 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  55.87 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  54.59 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  51.14 
 
 		 220 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  53.92 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  54.46 
 
 		 261 aa  232  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  53.59 
 
 		 220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.61 
 
 		 220 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  52.53 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.29 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  51.38 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  53.27 
 
 		 256 aa  227  8e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  52.53 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  51.61 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  52.07 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.46 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.184666 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  53.54 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  49.54 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  49.31 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2756  peroxidase  50.69 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  46.7 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.26 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>