More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0775 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  97.17 
 
 
213 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  96.7 
 
 
212 aa  427  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  89.15 
 
 
212 aa  400  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  84.91 
 
 
212 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  85.38 
 
 
212 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  85.38 
 
 
212 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  84.43 
 
 
212 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  84.91 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  85.38 
 
 
212 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  82.55 
 
 
212 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  84.91 
 
 
212 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  82.55 
 
 
212 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  82.08 
 
 
212 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  82.08 
 
 
212 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  82.08 
 
 
212 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  82.08 
 
 
212 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  78.77 
 
 
212 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  78.77 
 
 
212 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  78.77 
 
 
212 aa  357  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  78.77 
 
 
212 aa  357  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  77.73 
 
 
213 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  78.3 
 
 
212 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  77.83 
 
 
212 aa  354  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  77.83 
 
 
212 aa  354  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  78.67 
 
 
217 aa  354  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  76.89 
 
 
212 aa  354  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  78.2 
 
 
214 aa  353  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  78.77 
 
 
212 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  77.83 
 
 
212 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  75.94 
 
 
212 aa  348  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  75.94 
 
 
212 aa  343  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  74.53 
 
 
211 aa  332  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  70.28 
 
 
212 aa  332  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  72.17 
 
 
212 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  72.17 
 
 
211 aa  326  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  72.17 
 
 
211 aa  326  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  71.23 
 
 
212 aa  325  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  71.56 
 
 
213 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  71.7 
 
 
212 aa  323  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  69.67 
 
 
213 aa  322  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  70.28 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  71.23 
 
 
211 aa  320  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  70.62 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  71.23 
 
 
211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  71.03 
 
 
216 aa  316  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  69.34 
 
 
212 aa  315  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  69.16 
 
 
213 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  68.4 
 
 
211 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  66.98 
 
 
211 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  65.88 
 
 
215 aa  300  9e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  63.98 
 
 
210 aa  298  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  64.11 
 
 
212 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  65.09 
 
 
211 aa  296  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  66.19 
 
 
213 aa  292  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  64.15 
 
 
217 aa  293  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  62.86 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  66.02 
 
 
210 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  61.9 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  61.43 
 
 
212 aa  282  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  61.79 
 
 
212 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  62.86 
 
 
213 aa  278  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  59.42 
 
 
208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  57.34 
 
 
217 aa  268  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  56.62 
 
 
218 aa  267  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  58.45 
 
 
209 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  55.76 
 
 
217 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  56.16 
 
 
218 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  57.97 
 
 
209 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  55.5 
 
 
217 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.71 
 
 
220 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  55.91 
 
 
219 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  56.52 
 
 
209 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  56.36 
 
 
220 aa  255  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.55 
 
 
219 aa  250  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  52.49 
 
 
220 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  54.79 
 
 
219 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  52.97 
 
 
219 aa  248  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  58.41 
 
 
221 aa  246  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  55.71 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  53.37 
 
 
220 aa  244  9e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  52.51 
 
 
219 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  52.05 
 
 
219 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  52.51 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  51.82 
 
 
219 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  56.13 
 
 
261 aa  237  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.68 
 
 
219 aa  234  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  50.68 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  53.99 
 
 
256 aa  229  2e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  55.61 
 
 
213 aa  227  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  52.84 
 
 
233 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  45.66 
 
 
216 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2756  peroxidase  47.95 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  44.8 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>