More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2437 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  100 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  86.12 
 
 		 209 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  82.3 
 
 		 209 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  71.63 
 
 		 208 aa  321  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  59.9 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  58.94 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  61.17 
 
 		 213 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  58.94 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  58.74 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  59.31 
 
 		 212 aa  267  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  58.82 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  59.42 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  59.9 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  59.71 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  59.42 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  58.45 
 
 		 212 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  58.45 
 
 		 212 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  57 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  58.25 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  57.97 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  258  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  58.45 
 
 		 212 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  59.33 
 
 		 216 aa  257  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  57 
 
 		 212 aa  257  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  56.52 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  57.97 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  56.31 
 
 		 211 aa  256  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  58.45 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  57 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  58.05 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  57 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  56.04 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  55.56 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  57.49 
 
 		 212 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  55.83 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  57 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  55.83 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  54.55 
 
 		 210 aa  255  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  56.04 
 
 		 212 aa  254  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  56.04 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  57 
 
 		 212 aa  254  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  57 
 
 		 212 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  57.28 
 
 		 211 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  55.34 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  55.98 
 
 		 213 aa  251  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  55.34 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  56.04 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  57 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  55.83 
 
 		 211 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  56.8 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  55.83 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  54.59 
 
 		 212 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  55.5 
 
 		 213 aa  245  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  54.11 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  51.87 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  55.88 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  53.43 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  54.15 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  49.76 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  54.15 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  52.91 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  50.93 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  52.91 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  49.53 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  49.53 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  52.17 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  53.17 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.6 
 
 		 220 aa  234  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  48.58 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  49.27 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  48.13 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  50.74 
 
 		 220 aa  227  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  49.53 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  49.3 
 
 		 219 aa  224  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  48.13 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  49.76 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  48.84 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.39 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  46.76 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  50.93 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  48.84 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.51 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  46.98 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  43.46 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  46.98 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  47.42 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  49.25 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  47.21 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.25 
 
 		 213 aa  201  7e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  48.24 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>