More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3339 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  73.43 
 
 
210 aa  325  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  68.35 
 
 
219 aa  315  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  69.86 
 
 
211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  67.46 
 
 
211 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  68.42 
 
 
211 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  67.46 
 
 
211 aa  309  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  70.48 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  68.25 
 
 
215 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  68.57 
 
 
212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  68.08 
 
 
217 aa  302  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  68.57 
 
 
212 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  68.57 
 
 
212 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  68.1 
 
 
212 aa  301  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  68.1 
 
 
212 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  68.57 
 
 
212 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  67.77 
 
 
213 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  67.62 
 
 
212 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  66.99 
 
 
212 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  67.31 
 
 
212 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  67.62 
 
 
212 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  67.62 
 
 
212 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  67.62 
 
 
212 aa  297  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  68.57 
 
 
212 aa  297  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  67.14 
 
 
212 aa  296  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  67.62 
 
 
212 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  68.57 
 
 
212 aa  295  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  67.62 
 
 
212 aa  295  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  294  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  66.19 
 
 
212 aa  294  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  66.67 
 
 
213 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  65.71 
 
 
212 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  66.19 
 
 
212 aa  292  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  66.67 
 
 
212 aa  291  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  66.19 
 
 
212 aa  291  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  67.14 
 
 
212 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  66.19 
 
 
212 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  65.71 
 
 
212 aa  290  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  65.55 
 
 
211 aa  290  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  66.51 
 
 
213 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  65.71 
 
 
212 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  63.76 
 
 
220 aa  290  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.39 
 
 
220 aa  289  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  63.81 
 
 
212 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  66.51 
 
 
213 aa  288  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  64.59 
 
 
210 aa  288  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  66.03 
 
 
213 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  65.07 
 
 
214 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  64.76 
 
 
212 aa  284  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  60.65 
 
 
217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  65.57 
 
 
216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  63.64 
 
 
211 aa  281  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  61.24 
 
 
217 aa  281  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  63.64 
 
 
213 aa  281  8.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  64.42 
 
 
212 aa  278  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  58.72 
 
 
219 aa  278  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  59.91 
 
 
218 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  63.29 
 
 
212 aa  277  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  62.8 
 
 
212 aa  276  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  59.63 
 
 
219 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  61.72 
 
 
211 aa  275  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  62.98 
 
 
213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  62.2 
 
 
211 aa  271  6e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  57.41 
 
 
217 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  59.45 
 
 
218 aa  269  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  58.8 
 
 
217 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  60.95 
 
 
212 aa  268  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  61.72 
 
 
211 aa  268  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  55.96 
 
 
220 aa  261  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.8 
 
 
219 aa  258  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2167  peroxidase  56.88 
 
 
219 aa  258  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  54.13 
 
 
218 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  54.59 
 
 
208 aa  256  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  58.33 
 
 
209 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  55.71 
 
 
220 aa  254  7e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  57.35 
 
 
209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  57.42 
 
 
208 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  55.98 
 
 
209 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.05 
 
 
219 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  55.05 
 
 
219 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  53.67 
 
 
219 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  53.21 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  57.62 
 
 
221 aa  241  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  54.93 
 
 
256 aa  236  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  54.72 
 
 
261 aa  228  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00130  thioredoxin peroxidase, putative  53.1 
 
 
233 aa  222  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178013  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  50.75 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2756  peroxidase  48.62 
 
 
218 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0075  1-Cys peroxiredoxin  48.39 
 
 
216 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  47.67 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>