More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1330 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  100 
 
 		 213 aa  446  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  93.9 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  91.55 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  62.14 
 
 		 214 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  58.94 
 
 		 219 aa  271  6e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  54.67 
 
 		 214 aa  267  8.999999999999999e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  53.3 
 
 		 220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  53.52 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  52.83 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  53.33 
 
 		 214 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  55.09 
 
 		 217 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  51.66 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  55.34 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  52.17 
 
 		 215 aa  237  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.52 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  51.69 
 
 		 241 aa  235  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  50.23 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.1 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  48.62 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  48.61 
 
 		 240 aa  225  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  46.98 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  50.94 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  50 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  50.94 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.1 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  50.47 
 
 		 215 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  48.58 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  48.15 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.6 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  48.11 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  49.27 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  48.56 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  49.27 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  47.3 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.76 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  48.11 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  46.89 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  50.25 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  52.06 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  47.64 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  49.25 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  46.79 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  47.17 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  46.76 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  48.61 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  48.26 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  47.29 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  48.34 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  49.3 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  47.76 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  48.76 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  46.41 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  50.52 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  46.45 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.09 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  51.03 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  47.5 
 
 		 212 aa  201  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.82 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  47.39 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  47 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  47.26 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  49.75 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.26 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.78 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  46.27 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  46.27 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  45.59 
 
 		 213 aa  197  9e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  45.77 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  47.26 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  46.53 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  47 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  46.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  46.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.86 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  53.65 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  46.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  42.33 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.27 
 
 		 212 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  46.27 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  46.5 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  46.51 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  44.78 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  45.27 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  46.27 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  44.78 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.78 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  46.27 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  45.27 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>