More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1940 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  100 
 
 		 232 aa  473  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  60.91 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  59.47 
 
 		 221 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  60.95 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  58.37 
 
 		 214 aa  258  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  55.66 
 
 		 221 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  55.02 
 
 		 214 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  53.81 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  49.79 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  54.76 
 
 		 213 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  51.14 
 
 		 234 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  52.63 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.6 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.12 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  63.01 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.11 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.79 
 
 		 213 aa  214  8e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  48.1 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  48.33 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  47.85 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  44.44 
 
 		 226 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.89 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  44.3 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  47.89 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.93 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  48.11 
 
 		 214 aa  205  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  43.67 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  47.22 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  46.51 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.37 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  48.15 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  48.15 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  45.97 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  47.91 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.8 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  44.08 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  48.66 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  44.08 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  46.3 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  44.91 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  49.4 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  43.84 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  43.72 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.12 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  44.76 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.17 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  45.99 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  44.76 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  44.15 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  42.92 
 
 		 217 aa  175  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  42.79 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  44.55 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.78 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  45.45 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  43.46 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  47.73 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.27 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  41.86 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  41.78 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  41.67 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  45.41 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  42.93 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  49.4 
 
 		 225 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  44.92 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  42.65 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  41.31 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  41.31 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  40.57 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  48.81 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  45.74 
 
 		 212 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.16 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  45.21 
 
 		 212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  43.18 
 
 		 209 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  40.22 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  41.48 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  46.2 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  40.09 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.24 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  44.32 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  45.03 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  43.62 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.02 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.09 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  42.61 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  42.46 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  40.22 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  40.22 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  41.94 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.94 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  43.48 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.48 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  41.85 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  40.86 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  43.02 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  40.86 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  41.94 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  40.96 
 
 		 211 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  44.69 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.48 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  43.02 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>