More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0121 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  98.6 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  71.43 
 
 		 221 aa  341  5e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  73.02 
 
 		 225 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  72.99 
 
 		 212 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  72.3 
 
 		 216 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  72.09 
 
 		 220 aa  333  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  70.56 
 
 		 215 aa  332  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  70.62 
 
 		 212 aa  327  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  71.43 
 
 		 226 aa  324  7e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  68.84 
 
 		 213 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  68.84 
 
 		 220 aa  322  4e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  68.37 
 
 		 213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  62.21 
 
 		 223 aa  308  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  69.19 
 
 		 217 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  66.51 
 
 		 215 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  67.61 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  67.61 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  67.61 
 
 		 217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  66.2 
 
 		 217 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  66.98 
 
 		 213 aa  298  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  61.32 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  63.72 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  60.75 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  59.91 
 
 		 225 aa  294  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  60.66 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  59.43 
 
 		 225 aa  291  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.26 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  59.35 
 
 		 223 aa  290  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  62.68 
 
 		 221 aa  290  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.62 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  61.4 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  60 
 
 		 232 aa  280  1e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.75 
 
 		 224 aa  276  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  54.5 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  51.89 
 
 		 214 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  51.64 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  52.36 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  52.83 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.55 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  51.66 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  52.36 
 
 		 213 aa  223  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  50.45 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  52.61 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  51.89 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  49.77 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  53.3 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  50.94 
 
 		 213 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  50.93 
 
 		 241 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  47.73 
 
 		 240 aa  217  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  49.06 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  50 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.6 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.45 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.08 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  49.77 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  46.7 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  46.98 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  42.72 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  42.72 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.79 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.44 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.44 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  43.87 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  37.56 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.37 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.82 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  40.69 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  44.25 
 
 		 208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44.27 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  41.83 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  45.31 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.75 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  42.19 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.23 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  43.56 
 
 		 256 aa  153  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  44.21 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  49.4 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  40.53 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  40.62 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  40.62 
 
 		 211 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  43.23 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  42.78 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  42.11 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  44.27 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  40.72 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  42.71 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  42.71 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>