More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0463 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  100 
 
 		 215 aa  448  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  59.42 
 
 		 219 aa  255  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  59.42 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  57.49 
 
 		 214 aa  252  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.17 
 
 		 213 aa  237  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  53.69 
 
 		 220 aa  237  9e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.69 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  53.14 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  52.71 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  54.21 
 
 		 217 aa  227  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  52.17 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  50.72 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  50.74 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  51.23 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  50.74 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  52.97 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  49.3 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  52.97 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  47.49 
 
 		 221 aa  205  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  46.95 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  46.73 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  45.07 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  50.23 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  47.29 
 
 		 234 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  45.28 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  49.19 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.37 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  45.97 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.23 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  50.85 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.95 
 
 		 215 aa  191  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.32 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  46.7 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.12 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  46.23 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  44.65 
 
 		 212 aa  185  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  46.48 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  46.01 
 
 		 230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.71 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  44.34 
 
 		 215 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.79 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  45.07 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  42.25 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  43.84 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.39 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  43.4 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  42.92 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  44.34 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.25 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  42.45 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  44.1 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  41.78 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.12 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  42.63 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.67 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.41 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  45.31 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.54 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  43.09 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.85 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  45.41 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  42.86 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  42.11 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  42.56 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  42.11 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  42.92 
 
 		 215 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  45.2 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.74 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  42.35 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  41.58 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  41.4 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  39.62 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  41.12 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  42.59 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  39.49 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  43.94 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  40.61 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  40.93 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  40.93 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  39.49 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  42.86 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.86 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  41.05 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  44.07 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  42.65 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  43.24 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  43.94 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  41.38 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  42.16 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  45.3 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  41.49 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  40.53 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  44.09 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  41.05 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  39.47 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  42.11 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  42.11 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0482  peroxidase  40.69 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  42.7 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>