More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2393 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  100 
 
 		 213 aa  447  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  69.38 
 
 		 216 aa  330  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  71.01 
 
 		 212 aa  328  5.0000000000000004e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  67.91 
 
 		 221 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  68.84 
 
 		 215 aa  323  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  68.37 
 
 		 215 aa  321  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  66.82 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  68.25 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  66.82 
 
 		 215 aa  314  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  65.7 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  64.19 
 
 		 223 aa  312  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.82 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  66.67 
 
 		 224 aa  310  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.14 
 
 		 225 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  63.21 
 
 		 223 aa  307  9e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  64.93 
 
 		 213 aa  307  9e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  64.73 
 
 		 221 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  62.86 
 
 		 225 aa  304  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  65.58 
 
 		 226 aa  300  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  63.81 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  60.95 
 
 		 225 aa  296  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  63.51 
 
 		 215 aa  287  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  61.5 
 
 		 217 aa  284  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  61.03 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  60.66 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  60.56 
 
 		 217 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  60.56 
 
 		 217 aa  279  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  60 
 
 		 213 aa  276  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  58.14 
 
 		 225 aa  276  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.94 
 
 		 216 aa  275  4e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  57.28 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.67 
 
 		 224 aa  268  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.55 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  54.03 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  52.38 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  53.11 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  52.61 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  50.48 
 
 		 214 aa  214  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  48.17 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.44 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.85 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  48.82 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  47.03 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  46.33 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  47.71 
 
 		 228 aa  204  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  47.85 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  47.42 
 
 		 241 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.41 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  48.8 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  48.82 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  53.97 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  46.92 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.14 
 
 		 213 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.76 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.48 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  38.65 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  43.87 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  43.87 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  41.95 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.95 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  43.81 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.51 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  46.07 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  41.49 
 
 		 221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  42.16 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.61 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  44.21 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.04 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  39.62 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.88 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.88 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  42.71 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  43.1 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  42.71 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  42.78 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  44.44 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.27 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  42.93 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  44.44 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  43.22 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40.91 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  44.44 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  42.19 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  42.41 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  44.51 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  41.88 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  43.96 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  41.88 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.44 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  42.19 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  40.31 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  41.15 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  42.19 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  42.63 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  41.36 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  42.86 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  42.86 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  41.36 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  41.36 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>