More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1420 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  63.72 
 
 
226 aa  309  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  60.45 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  60 
 
 
229 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  51.33 
 
 
220 aa  251  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  52.17 
 
 
230 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  52.47 
 
 
213 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  53 
 
 
214 aa  248  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  52.91 
 
 
221 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  52.29 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  52.51 
 
 
214 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.83 
 
 
219 aa  241  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  52.73 
 
 
212 aa  238  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  52.07 
 
 
241 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.55 
 
 
214 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50 
 
 
213 aa  229  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.55 
 
 
225 aa  226  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  48.15 
 
 
223 aa  226  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.61 
 
 
213 aa  225  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  50 
 
 
213 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.02 
 
 
213 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  49.09 
 
 
212 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  47.73 
 
 
215 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  47.73 
 
 
215 aa  217  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  47.53 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.31 
 
 
215 aa  211  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  45.49 
 
 
223 aa  211  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  45.21 
 
 
217 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  48.18 
 
 
220 aa  209  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  46.33 
 
 
213 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.73 
 
 
224 aa  205  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  44.8 
 
 
226 aa  204  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.8 
 
 
220 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  47.44 
 
 
221 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  47.44 
 
 
221 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  49.32 
 
 
213 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  47.22 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.37 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  44.39 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  46.73 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  42.92 
 
 
234 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  45.05 
 
 
224 aa  198  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  45.95 
 
 
224 aa  198  7e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  46.64 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.09 
 
 
216 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.69 
 
 
210 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  44.8 
 
 
215 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  47.64 
 
 
221 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.45 
 
 
215 aa  191  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  45.25 
 
 
223 aa  191  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  44.64 
 
 
221 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  43.24 
 
 
225 aa  191  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  45.58 
 
 
217 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  44.55 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  45.74 
 
 
217 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.42 
 
 
217 aa  189  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  42.34 
 
 
215 aa  187  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  50.27 
 
 
208 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  42.04 
 
 
230 aa  186  4e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  44.69 
 
 
217 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  44.69 
 
 
217 aa  185  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  45.25 
 
 
212 aa  185  6e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  42.08 
 
 
213 aa  185  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  45.25 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  48.91 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  48.11 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  47.57 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  42.04 
 
 
232 aa  183  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  48.37 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  45.9 
 
 
209 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  48.92 
 
 
213 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  49.46 
 
 
212 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.21 
 
 
208 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  46.67 
 
 
211 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.64 
 
 
217 aa  175  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  47.72 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  47.85 
 
 
212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.64 
 
 
217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  45.31 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  46.94 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  46.15 
 
 
213 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  46.49 
 
 
212 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.87 
 
 
211 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.87 
 
 
211 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  46.81 
 
 
216 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  47.31 
 
 
212 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  46.24 
 
 
211 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  48.11 
 
 
217 aa  168  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  45.54 
 
 
261 aa  168  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  41.38 
 
 
211 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  45.41 
 
 
212 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  45.7 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  46.77 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  46.45 
 
 
212 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  45.7 
 
 
212 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  45.7 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  45.7 
 
 
212 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  45.95 
 
 
213 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  45.7 
 
 
212 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.24 
 
 
212 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>