More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1762 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  94.47 
 
 
217 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  92.17 
 
 
217 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  87.1 
 
 
217 aa  400  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  72.69 
 
 
226 aa  339  1e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  68.08 
 
 
215 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  67.61 
 
 
215 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  64.06 
 
 
212 aa  296  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.9 
 
 
225 aa  295  4e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  62.84 
 
 
221 aa  292  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  62.5 
 
 
223 aa  291  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  62.96 
 
 
213 aa  288  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  62.21 
 
 
212 aa  287  8e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  61.29 
 
 
216 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.65 
 
 
220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  60.37 
 
 
215 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  60.56 
 
 
213 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  61.03 
 
 
220 aa  276  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  61.68 
 
 
215 aa  270  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  60.28 
 
 
213 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  58.06 
 
 
224 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  55.5 
 
 
225 aa  254  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  54.42 
 
 
225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.84 
 
 
215 aa  252  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  54.79 
 
 
224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.96 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  55.56 
 
 
215 aa  250  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  55.5 
 
 
225 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  55.09 
 
 
232 aa  248  4e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  53.7 
 
 
230 aa  248  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  54.84 
 
 
221 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  55.3 
 
 
223 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.23 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.38 
 
 
219 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.55 
 
 
214 aa  202  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  46.82 
 
 
228 aa  197  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  46.4 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  48.18 
 
 
223 aa  193  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  47.2 
 
 
214 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  47.27 
 
 
220 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  49.06 
 
 
213 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  47.27 
 
 
214 aa  185  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  44.69 
 
 
240 aa  185  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  48.29 
 
 
216 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 
213 aa  182  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  42.08 
 
 
226 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  49.47 
 
 
217 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.36 
 
 
213 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  44.09 
 
 
213 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  44.65 
 
 
230 aa  175  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  44.98 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.4 
 
 
213 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  41.31 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  40.93 
 
 
215 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  45.78 
 
 
215 aa  159  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  43.13 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.72 
 
 
212 aa  153  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.79 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.79 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  39.05 
 
 
221 aa  151  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  42.06 
 
 
212 aa  150  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  39.05 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  41.75 
 
 
212 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  41.75 
 
 
212 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  39.89 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  36.71 
 
 
234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.81 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.81 
 
 
217 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  41.76 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  43.72 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40.09 
 
 
261 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  38.1 
 
 
221 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  39.69 
 
 
212 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  40.21 
 
 
212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  41.76 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  40.72 
 
 
217 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.24 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  41.24 
 
 
212 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  41.24 
 
 
212 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  41.36 
 
 
210 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  40.72 
 
 
212 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  39.69 
 
 
212 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  41.24 
 
 
212 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  39.69 
 
 
212 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  42.31 
 
 
209 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  40.21 
 
 
212 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  39.69 
 
 
212 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  39.39 
 
 
208 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  41.24 
 
 
212 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.21 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  40.49 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  39.38 
 
 
208 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  40.32 
 
 
212 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>