More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2700 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  100 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.33 
 
 		 210 aa  278  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.83 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  61.95 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  55.03 
 
 		 214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  65.52 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  65.52 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  60.11 
 
 		 241 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  63.01 
 
 		 232 aa  226  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  51.74 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  50.74 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  56.35 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  51.85 
 
 		 213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  50.24 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  53.3 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.1 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  51.03 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.18 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  50 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  49.19 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  50.27 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.05 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  45.45 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.41 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  43.96 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  42.86 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  42.86 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  39.9 
 
 		 223 aa  171  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  43.68 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41.43 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  41.06 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.62 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  44.25 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.46 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  40.2 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  45.98 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.96 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  37.14 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  39.81 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  43.1 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  37.14 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  39.2 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  39.71 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  43.96 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  44.25 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  44.25 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  39.23 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  39.23 
 
 		 212 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.71 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  43.16 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.68 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  39.5 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  39.58 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  37.14 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  38.76 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  38.28 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  37.86 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  38.28 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  39.05 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  37.32 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  39 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  45.51 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  37.32 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  39.71 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  37.62 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  38.28 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  37.62 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  43.1 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  40 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  39.5 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  36.19 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  41.67 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  36.49 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  36.49 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  39.58 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  39 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  36.19 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  41.01 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  36.19 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  37.32 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.14 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  37.14 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  37.62 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  39.13 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  41.38 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  39.18 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  41.62 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  37.14 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  38.19 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  35.71 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  36.84 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  37.14 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  41.55 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>