More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0945 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  91.98 
 
 		 212 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  65.33 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  55.5 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  57.14 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  59.12 
 
 		 232 aa  227  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  59.24 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  59.24 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  57.71 
 
 		 241 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  53.98 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  52.88 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  51.89 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  52.84 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  50 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  53.8 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  51.37 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.04 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  49.72 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  51.72 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  48.69 
 
 		 240 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  47.73 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  43.78 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  47.12 
 
 		 215 aa  187  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.97 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  46.15 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  47.16 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  45.6 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  45.18 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  44.07 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  45.37 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  42.44 
 
 		 216 aa  174  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  42.93 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  46.24 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  45.09 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  46.24 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.4 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  44.33 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  46.82 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  46.82 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.5 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.71 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  40 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.93 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  42.77 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  40.53 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  44.51 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  40.45 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.42 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  44.51 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  37.86 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  42.29 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  42.94 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.17 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.17 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  40.45 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  39.69 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  42.37 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  39.59 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  42.78 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  43.43 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  41.81 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  42.78 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  40.68 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  44 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  44.26 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  42.37 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  43.79 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  41.34 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  41.24 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  42.37 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  43.79 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  41.24 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0701  Peroxidase  41.24 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0373807  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  41.38 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  43.2 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  38.59 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  41.24 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  40.11 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  38.16 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  37.85 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  38.59 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  42.53 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  37.57 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  38.59 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  39.55 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  40.1 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.08 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  38.98 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  40.68 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  41.11 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  36.32 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  42.2 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  39.22 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  39.55 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  43.11 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  41.24 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.68 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  40.68 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  40.68 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.68 
 
 		 212 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>