More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2195 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  100 
 
 
224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  84.82 
 
 
224 aa  410  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  84.3 
 
 
223 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  84.38 
 
 
225 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  81.28 
 
 
221 aa  387  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  76.44 
 
 
225 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  74.76 
 
 
215 aa  343  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  68.25 
 
 
213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  64.93 
 
 
220 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  67.14 
 
 
216 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  64.79 
 
 
215 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  63.51 
 
 
212 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  64.62 
 
 
212 aa  299  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  61.79 
 
 
215 aa  297  8e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.68 
 
 
225 aa  296  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  62.56 
 
 
221 aa  296  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  61.32 
 
 
215 aa  296  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  62.79 
 
 
223 aa  290  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  60.19 
 
 
213 aa  285  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  60.27 
 
 
226 aa  279  3e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.41 
 
 
220 aa  274  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  57.94 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  55.71 
 
 
225 aa  271  5.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  58.6 
 
 
213 aa  268  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  58.53 
 
 
217 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  57.87 
 
 
217 aa  260  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  58.53 
 
 
217 aa  260  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  58.06 
 
 
217 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  58.06 
 
 
217 aa  259  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.42 
 
 
216 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.87 
 
 
224 aa  254  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  53.46 
 
 
230 aa  249  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.24 
 
 
215 aa  242  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  51.15 
 
 
232 aa  241  7.999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.82 
 
 
213 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.77 
 
 
214 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.64 
 
 
213 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  45.78 
 
 
220 aa  205  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  49.3 
 
 
214 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  48.11 
 
 
213 aa  201  5e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  48.83 
 
 
219 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  48.11 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  48.83 
 
 
213 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.7 
 
 
229 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  45.95 
 
 
240 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  45.91 
 
 
228 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  44.81 
 
 
223 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  42.92 
 
 
226 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  44.95 
 
 
216 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  44.86 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  44.81 
 
 
241 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.19 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.01 
 
 
217 aa  174  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  47.73 
 
 
232 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  47.37 
 
 
217 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  44.19 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.39 
 
 
212 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.88 
 
 
212 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  41.67 
 
 
221 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  42.33 
 
 
212 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  46.03 
 
 
208 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.67 
 
 
221 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.88 
 
 
212 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.64 
 
 
208 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  36.27 
 
 
234 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.31 
 
 
217 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.85 
 
 
217 aa  156  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  45.03 
 
 
212 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  43.19 
 
 
217 aa  155  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  45.03 
 
 
212 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  44.39 
 
 
212 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.93 
 
 
209 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  37.86 
 
 
215 aa  154  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  45.03 
 
 
212 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  44.92 
 
 
212 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.39 
 
 
213 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  44.67 
 
 
212 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  43.88 
 
 
212 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  44.39 
 
 
212 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  43.37 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.38 
 
 
210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  43.37 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  40.95 
 
 
212 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5194  Peroxidase  44.5 
 
 
211 aa  151  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.600371  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.97 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40.91 
 
 
261 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  43.88 
 
 
212 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  38.97 
 
 
215 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  41.38 
 
 
213 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  44.39 
 
 
212 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.32 
 
 
212 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  43.88 
 
 
212 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  39.13 
 
 
217 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  41.06 
 
 
213 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  43.78 
 
 
212 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.79 
 
 
211 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>