More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0959 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  100 
 
 
228 aa  474  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  80.54 
 
 
226 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  71.05 
 
 
229 aa  350  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  60.45 
 
 
240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  54.88 
 
 
214 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  54.46 
 
 
214 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  52.8 
 
 
213 aa  246  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  51.61 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  53.64 
 
 
216 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  50.44 
 
 
220 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  50 
 
 
214 aa  235  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  51.58 
 
 
221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  51.6 
 
 
212 aa  232  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.58 
 
 
213 aa  231  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  48.61 
 
 
219 aa  230  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  48.83 
 
 
213 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.98 
 
 
213 aa  225  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.44 
 
 
225 aa  224  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  47.25 
 
 
223 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  50.23 
 
 
212 aa  223  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.6 
 
 
224 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  49.77 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  49.12 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  50 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  49.77 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  50.68 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  46.05 
 
 
241 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  48.46 
 
 
223 aa  214  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  50 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.36 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.02 
 
 
220 aa  211  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.77 
 
 
215 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.3 
 
 
232 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.95 
 
 
216 aa  208  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  49.32 
 
 
213 aa  205  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  47.71 
 
 
213 aa  204  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  43.64 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  45.07 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  47.49 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  46.82 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  46.82 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  47.73 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.22 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  44.93 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  42.99 
 
 
234 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  45.91 
 
 
224 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  43.94 
 
 
221 aa  194  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  48.1 
 
 
230 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  44.75 
 
 
213 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  41.43 
 
 
221 aa  193  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  45 
 
 
225 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.43 
 
 
221 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  44.95 
 
 
225 aa  191  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  47.27 
 
 
215 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  45.21 
 
 
215 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  45.91 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  44.75 
 
 
223 aa  189  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.03 
 
 
217 aa  188  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  42.79 
 
 
221 aa  187  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  44.29 
 
 
232 aa  187  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.05 
 
 
212 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  48.35 
 
 
209 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  45.81 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.6 
 
 
210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  43.01 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  43.01 
 
 
211 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  45.54 
 
 
212 aa  180  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  46.15 
 
 
212 aa  180  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  46.7 
 
 
209 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  44.78 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  46.5 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  46.7 
 
 
209 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  48.63 
 
 
212 aa  177  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  48.63 
 
 
212 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  45.59 
 
 
208 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  44.81 
 
 
212 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  45 
 
 
217 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  42.86 
 
 
208 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  46.99 
 
 
212 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  44.75 
 
 
211 aa  176  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  45.9 
 
 
213 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.26 
 
 
212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.26 
 
 
212 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  42.79 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.27 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  43.01 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  47.54 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  45.9 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  44.26 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.17 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  43.72 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  43.17 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  43.17 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  43.17 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>