More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1379 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  100 
 
 
213 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  70.89 
 
 
220 aa  333  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  70.19 
 
 
216 aa  322  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.3 
 
 
220 aa  321  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  68.37 
 
 
215 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  67.91 
 
 
215 aa  317  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  68.42 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  66.82 
 
 
221 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  67.44 
 
 
215 aa  309  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  64.93 
 
 
213 aa  307  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.76 
 
 
225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  64.11 
 
 
212 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  63.13 
 
 
223 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  65.09 
 
 
215 aa  295  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  63.98 
 
 
223 aa  294  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  61.14 
 
 
225 aa  292  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  63.64 
 
 
221 aa  291  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  62.56 
 
 
225 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  63.13 
 
 
226 aa  290  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  61.06 
 
 
224 aa  287  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  60.38 
 
 
215 aa  286  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.09 
 
 
215 aa  285  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  60.19 
 
 
224 aa  285  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  58.22 
 
 
230 aa  276  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  59.62 
 
 
232 aa  275  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  61.68 
 
 
217 aa  271  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  61.21 
 
 
217 aa  269  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  56.68 
 
 
225 aa  268  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.81 
 
 
216 aa  268  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  61.21 
 
 
217 aa  267  7e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  60.28 
 
 
217 aa  266  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  60.28 
 
 
217 aa  266  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  61.03 
 
 
213 aa  263  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.72 
 
 
224 aa  249  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  53.08 
 
 
219 aa  225  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  51.17 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  51.42 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  51.43 
 
 
223 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  50.67 
 
 
226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  51.42 
 
 
214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  50 
 
 
213 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.42 
 
 
213 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  49.55 
 
 
229 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  48.6 
 
 
241 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  48.62 
 
 
213 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  49.32 
 
 
228 aa  205  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  48.82 
 
 
216 aa  205  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.79 
 
 
213 aa  205  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  48.34 
 
 
220 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  49.32 
 
 
240 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  49.29 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  48.15 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  51.08 
 
 
217 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  48.37 
 
 
212 aa  184  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  48.37 
 
 
212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.52 
 
 
213 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.95 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  43.84 
 
 
215 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  43.63 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.33 
 
 
217 aa  177  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  43.63 
 
 
221 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.86 
 
 
217 aa  175  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  44.39 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.93 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.33 
 
 
210 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  44.08 
 
 
217 aa  166  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  46.84 
 
 
210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  36.15 
 
 
234 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  43.09 
 
 
221 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.5 
 
 
212 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.99 
 
 
213 aa  156  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  45.56 
 
 
209 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  44.44 
 
 
210 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  44.27 
 
 
211 aa  154  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  42.41 
 
 
213 aa  154  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  43.98 
 
 
217 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  41.38 
 
 
208 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  42.41 
 
 
212 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  43.98 
 
 
213 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  42.41 
 
 
212 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  43.46 
 
 
212 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  42.49 
 
 
208 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  42.11 
 
 
211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  43.43 
 
 
212 aa  151  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  42.11 
 
 
208 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  41.24 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  43.98 
 
 
212 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  41.88 
 
 
212 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  45.11 
 
 
212 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  42.42 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  40.84 
 
 
212 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  45.86 
 
 
213 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.88 
 
 
212 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  41.92 
 
 
217 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  42.93 
 
 
215 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  41.88 
 
 
212 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  40.91 
 
 
212 aa  148  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.79 
 
 
211 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.79 
 
 
211 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.84 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>