More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0413 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  100 
 
 
217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  92.17 
 
 
217 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  91.71 
 
 
217 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  92.17 
 
 
217 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  87.56 
 
 
217 aa  407  1e-113  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  71.76 
 
 
226 aa  337  9e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  69.19 
 
 
215 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  69.19 
 
 
215 aa  307  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.37 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  63.76 
 
 
221 aa  295  4e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  64.19 
 
 
212 aa  292  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  64.35 
 
 
213 aa  292  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  62.96 
 
 
223 aa  290  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.62 
 
 
220 aa  290  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  62.33 
 
 
216 aa  288  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  62.33 
 
 
212 aa  284  9e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  61.29 
 
 
215 aa  280  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  60.66 
 
 
213 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  61.4 
 
 
215 aa  275  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  61.03 
 
 
220 aa  272  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  61.21 
 
 
213 aa  269  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  55.81 
 
 
225 aa  260  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  58.53 
 
 
224 aa  260  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  56.42 
 
 
225 aa  259  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.87 
 
 
216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  56.42 
 
 
225 aa  254  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  56.36 
 
 
224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  56.02 
 
 
232 aa  252  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  56.22 
 
 
223 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.35 
 
 
215 aa  250  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  55.09 
 
 
215 aa  247  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.05 
 
 
224 aa  247  8e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  54.21 
 
 
230 aa  246  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  55 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  52.56 
 
 
219 aa  210  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  49.09 
 
 
214 aa  202  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  47.56 
 
 
229 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  47.49 
 
 
228 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  46.64 
 
 
240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  48.37 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  48.85 
 
 
214 aa  193  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  49.53 
 
 
213 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  49.52 
 
 
216 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  47 
 
 
220 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  48.18 
 
 
214 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.16 
 
 
213 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  42.73 
 
 
226 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.08 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  47.85 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  43.78 
 
 
213 aa  178  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  45.93 
 
 
241 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  44.39 
 
 
230 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.6 
 
 
213 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  41.78 
 
 
232 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  42.59 
 
 
215 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  43.46 
 
 
215 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  43.19 
 
 
212 aa  157  8e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  41.78 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.38 
 
 
212 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.43 
 
 
210 aa  154  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  41.63 
 
 
217 aa  151  7e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  38.57 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  38.57 
 
 
221 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.07 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.07 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  41.15 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  38.86 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  41.27 
 
 
209 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  37.7 
 
 
221 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  42.79 
 
 
256 aa  142  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40 
 
 
261 aa  142  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  35.27 
 
 
234 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  39.79 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  39.69 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  39.69 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  41.21 
 
 
209 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  39.69 
 
 
217 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  42.31 
 
 
209 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  39.29 
 
 
212 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  41.21 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  40.84 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  37.17 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14785  predicted protein  39.43 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  37.17 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.69 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  36.6 
 
 
208 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50084  predicted protein  36.36 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  39.18 
 
 
212 aa  131  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  39.69 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  39.18 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  37.8 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  39.11 
 
 
217 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  41.21 
 
 
212 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  38.66 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>