More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1262 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  91.98 
 
 
212 aa  413  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  88.63 
 
 
217 aa  393  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.26 
 
 
217 aa  387  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  81.04 
 
 
217 aa  360  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  82.94 
 
 
217 aa  344  4e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  52.4 
 
 
214 aa  215  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  50.96 
 
 
230 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  50.23 
 
 
220 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  50 
 
 
216 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.55 
 
 
213 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  50.71 
 
 
214 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  51.03 
 
 
213 aa  201  7e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  52.06 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  49.75 
 
 
213 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  49.52 
 
 
219 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  48.13 
 
 
214 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  50.23 
 
 
215 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  48.45 
 
 
241 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  47.76 
 
 
217 aa  189  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  49.77 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  48.82 
 
 
212 aa  188  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  47.73 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  48.34 
 
 
212 aa  184  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  48.37 
 
 
213 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.66 
 
 
216 aa  184  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.39 
 
 
215 aa  184  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  45.25 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.36 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.77 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  45.81 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  46.51 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.64 
 
 
225 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  44.71 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  45.05 
 
 
215 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  42.79 
 
 
215 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.83 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  47.2 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  46.67 
 
 
216 aa  177  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  46.92 
 
 
220 aa  177  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  40.95 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  45.97 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  41.55 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  46.88 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  43.46 
 
 
232 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  43.87 
 
 
213 aa  170  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  41.03 
 
 
221 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  44.7 
 
 
226 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  41.03 
 
 
221 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  44.19 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  42.33 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  45.02 
 
 
215 aa  162  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.6 
 
 
224 aa  162  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  44.13 
 
 
215 aa  161  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  43.13 
 
 
213 aa  161  7e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  41.31 
 
 
225 aa  160  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  41.21 
 
 
213 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  42.33 
 
 
221 aa  158  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  42.65 
 
 
225 aa  157  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  43.19 
 
 
217 aa  157  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.74 
 
 
212 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  43.19 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  47.13 
 
 
261 aa  154  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  45.11 
 
 
209 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73480  predicted protein  44.33 
 
 
221 aa  154  9e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  41.86 
 
 
223 aa  154  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.62 
 
 
212 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  42.72 
 
 
217 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  42.72 
 
 
217 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  41.78 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  45.5 
 
 
215 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  39.53 
 
 
225 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  41.18 
 
 
211 aa  151  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  44.86 
 
 
212 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  40.69 
 
 
211 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  40.69 
 
 
211 aa  150  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2439  peroxidase  43.41 
 
 
212 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.44 
 
 
213 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  44.86 
 
 
212 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  43.55 
 
 
256 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  45.99 
 
 
212 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1458  Peroxidase  41.03 
 
 
219 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  43.78 
 
 
212 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.08 
 
 
210 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  43.78 
 
 
212 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  41.15 
 
 
219 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  43.24 
 
 
212 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  46.37 
 
 
213 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  44.1 
 
 
208 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  44.13 
 
 
212 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  43.24 
 
 
213 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  39.29 
 
 
217 aa  148  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4088  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.6 
 
 
219 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  42.86 
 
 
219 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  40.51 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4026  1-Cys peroxiredoxin  41.62 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  43.24 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  44.32 
 
 
212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  43.78 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44.5 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>