More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1196 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  83.49 
 
 		 212 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  72.99 
 
 		 215 aa  336  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  73.46 
 
 		 215 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  71.16 
 
 		 221 aa  335  1.9999999999999998e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  70.62 
 
 		 216 aa  333  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  71.15 
 
 		 215 aa  324  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  66.35 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.98 
 
 		 225 aa  315  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  65.7 
 
 		 213 aa  312  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  67.44 
 
 		 226 aa  310  7.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.42 
 
 		 220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  63.51 
 
 		 224 aa  301  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  64.11 
 
 		 213 aa  301  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  64.52 
 
 		 217 aa  298  6e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  64.06 
 
 		 217 aa  296  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  64.06 
 
 		 217 aa  296  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  66.98 
 
 		 213 aa  296  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  63.26 
 
 		 215 aa  295  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  61.32 
 
 		 224 aa  295  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  64.19 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  63.51 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  61.9 
 
 		 223 aa  291  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  63.13 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  61.61 
 
 		 225 aa  291  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  61.21 
 
 		 223 aa  290  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  61.61 
 
 		 221 aa  288  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  58.96 
 
 		 225 aa  284  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60 
 
 		 215 aa  280  9e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  57.87 
 
 		 225 aa  279  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  57.89 
 
 		 230 aa  274  8e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  55.98 
 
 		 232 aa  263  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.5 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.4 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  56.34 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  56.34 
 
 		 219 aa  237  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  53.77 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  53.88 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  53.74 
 
 		 214 aa  230  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  53.08 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  53.05 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  53.3 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  51.64 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  50.94 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  50.23 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  51.64 
 
 		 230 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.32 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  49.09 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  53.55 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  52.36 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  60 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  51.42 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  50.23 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  46.3 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.05 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.85 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  48.34 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  46.92 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  39.23 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  43.63 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  43.63 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.93 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  42.93 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.93 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.93 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.76 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.27 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.76 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  42.79 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  45.79 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  42.55 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44.27 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  46.07 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  43.1 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  42.19 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  42.19 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  44.51 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  44.5 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  43.78 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.97 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  45 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  44.51 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.68 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  41.62 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  42.19 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  43.96 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.16 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  44.62 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  43.23 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  40.8 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  43.39 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.27 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  43.39 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  45.4 
 
 		 209 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  42.71 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  44.32 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.02 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  42.19 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  42.19 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>