More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3838 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  98.64 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  60.91 
 
 		 232 aa  275  4e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  60.98 
 
 		 241 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  57.07 
 
 		 214 aa  258  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  60.29 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  55.5 
 
 		 234 aa  247  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  54.15 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  55.34 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  53.66 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  52.2 
 
 		 216 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  53.27 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  65.52 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.36 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.24 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.22 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  52.71 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.73 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.15 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  50.24 
 
 		 213 aa  214  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  47.6 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  52.97 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  49.27 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  50.5 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  47.44 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  44.86 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  41.43 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  41.63 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  43.08 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  46.6 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.86 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  44.61 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  42.72 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  42.72 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  46.57 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.33 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  40.74 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  42.06 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  43.63 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  44.33 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.78 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.51 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  43.63 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  39.71 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.11 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.46 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  41.71 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  42.16 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  41.95 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  41.03 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.41 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  44 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  41.15 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  43.55 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  41.88 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  41.36 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  45.45 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  41.4 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  39.27 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  41.67 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  42.16 
 
 		 224 aa  161  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  41.63 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  39.27 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  39.27 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3637  Peroxidase  42.5 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0335731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  39.9 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.03 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  39.25 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4841  peroxidase  42.7 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  40.1 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  39.64 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  41.88 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  40 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  40.62 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  39.11 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  40.84 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  39.2 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  41.67 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  40.69 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.08 
 
 		 220 aa  154  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  41.9 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  42.22 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  39.66 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  39.19 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  39.11 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  39.11 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  39.11 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  39.66 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  39.66 
 
 		 212 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  39.66 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  39.27 
 
 		 212 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  39.11 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  40.1 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  42.31 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  39.66 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  39.66 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  39.11 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  40.33 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2647  Peroxidase  40.74 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  38.24 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>