More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0307 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  100 
 
 		 223 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  74.65 
 
 		 219 aa  343  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  69.67 
 
 		 214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  61.84 
 
 		 220 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  60.87 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  62.44 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  60.19 
 
 		 230 aa  275  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  58.77 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  58.65 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  59.62 
 
 		 214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  57.77 
 
 		 216 aa  268  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  55.66 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  53.3 
 
 		 213 aa  254  8e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  59.42 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  52.83 
 
 		 213 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52.49 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  56.28 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  54.03 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.54 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  53.77 
 
 		 212 aa  231  9e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.56 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  48.15 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  50.23 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.82 
 
 		 225 aa  224  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  53.28 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  47.25 
 
 		 228 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.12 
 
 		 213 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  51.89 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  51.89 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  52.71 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  52.07 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.66 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  52.71 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  51.43 
 
 		 213 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  47.89 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  48.15 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  51.03 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.87 
 
 		 216 aa  204  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  46.92 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  48.82 
 
 		 230 aa  203  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  49.76 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  43.06 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  46.92 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.72 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  42.99 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  46.92 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  47.73 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  45.28 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.57 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  48.37 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  47.37 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.98 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  46.48 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  48.18 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  48.18 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  44.81 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  49.43 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  46.79 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  48.61 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  43.19 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  44.55 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.72 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  42.53 
 
 		 223 aa  187  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  44.29 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  45.55 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  45.55 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1307  peroxidase  46.39 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.26 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  45 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  46 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  45.19 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  45 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  44.71 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  44 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  44 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.73 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  46.73 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.5 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.5 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  43.46 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  43.54 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  45.23 
 
 		 215 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  44.5 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  47.43 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  44.33 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  46 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  45 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  47.43 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  44 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  43.5 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0859  Peroxidase  45.41 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.778526  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  44.55 
 
 		 218 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  44 
 
 		 212 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  43.72 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0387  Peroxidase  45.16 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0412974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  42.93 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>