More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1460 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  94.37 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  91.55 
 
 		 213 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  63.59 
 
 		 214 aa  278  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  61.35 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  54.67 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  57.49 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  55.4 
 
 		 213 aa  258  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  55.66 
 
 		 223 aa  256  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  54.72 
 
 		 220 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  56.8 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  52.61 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  55.56 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  54.29 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52.23 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.46 
 
 		 213 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  53.14 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  52.56 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  50.23 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  48.83 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  50 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  53.3 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  49.54 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  53.3 
 
 		 220 aa  222  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.91 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  50.94 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  53.3 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  52.83 
 
 		 215 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  50.24 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  50.24 
 
 		 221 aa  214  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.54 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  50 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  50.24 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  55.21 
 
 		 217 aa  211  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  47.85 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  48.4 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  48.62 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.18 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  47.69 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  48.28 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  49.77 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  46.58 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  47.85 
 
 		 213 aa  202  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  49.54 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  50 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  48.11 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  51.03 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  49.25 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  47.5 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.76 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  48.24 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  48 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  52.06 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.7 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  49.3 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  46.23 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  47.26 
 
 		 212 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  48.26 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  45.41 
 
 		 213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  51.55 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  46.77 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  46.92 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  46.27 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  47.67 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  47 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  46.27 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  48.24 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  47.5 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  46.77 
 
 		 261 aa  193  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  47 
 
 		 212 aa  193  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  45.02 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  47.06 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  44.78 
 
 		 213 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  46.27 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  46.39 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  42.93 
 
 		 234 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  44.78 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  45.27 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  44.78 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  44.78 
 
 		 212 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  48.5 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  44.5 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  45.27 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.27 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  45.27 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  45.77 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  54.69 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  44.5 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  45.77 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  47.26 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>