More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00098 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  100 
 
 		 216 aa  453  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  81.73 
 
 		 213 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  73.91 
 
 		 214 aa  335  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  70.45 
 
 		 220 aa  335  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  68.25 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  68.6 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  69.52 
 
 		 214 aa  308  5e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  64.76 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.73 
 
 		 213 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  59.15 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  57.77 
 
 		 223 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  56.31 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  56.8 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  55.34 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  54.76 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.29 
 
 		 240 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  53.81 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  53.64 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  52.2 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  53 
 
 		 221 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  50.9 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  51.22 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  53.08 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  51.74 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  50 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  51.36 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  51.6 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  52.61 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  52.61 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  49.78 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.24 
 
 		 225 aa  221  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  53.55 
 
 		 212 aa  221  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  51.23 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.23 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.63 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  51.41 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.84 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  51.18 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  50.24 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  50.24 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  50 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  48.82 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.7 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  47 
 
 		 216 aa  204  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  48.58 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.82 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  48.82 
 
 		 213 aa  201  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  47.44 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.39 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  46.98 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  45.71 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  46.3 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  44.95 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  47.17 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  49.52 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  47.85 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  45.12 
 
 		 225 aa  187  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.29 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.76 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  45.41 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  46.08 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  45.07 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  48.29 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  42.66 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  48.29 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  42.66 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  45 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  47.32 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  49.05 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  44.56 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  47.09 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  41.55 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.81 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  46.37 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  40.5 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  45.93 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  42.79 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  40.5 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  42.78 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.28 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.28 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.86 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  42.79 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  42.5 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  44.94 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  41.35 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  43.01 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  41.94 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  40.1 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  41.55 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  42.47 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  42.79 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  42.79 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  40.5 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  42.47 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  43.65 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  39.9 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  41.29 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  42.29 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  41.79 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>