More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1445 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  83.49 
 
 
212 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  76.28 
 
 
221 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  73.46 
 
 
216 aa  344  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  70.62 
 
 
215 aa  328  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  71.01 
 
 
213 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  70.62 
 
 
215 aa  327  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  68.72 
 
 
220 aa  327  6e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.83 
 
 
225 aa  325  3e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  70.19 
 
 
215 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  68.42 
 
 
213 aa  313  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.82 
 
 
220 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  67.91 
 
 
226 aa  310  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  64.62 
 
 
224 aa  299  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  61.68 
 
 
223 aa  294  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  63.21 
 
 
221 aa  291  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  61.03 
 
 
224 aa  290  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  63.51 
 
 
215 aa  287  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  62.33 
 
 
215 aa  287  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  62.21 
 
 
217 aa  287  8e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  62.21 
 
 
217 aa  287  8e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  61.75 
 
 
217 aa  286  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  62.67 
 
 
217 aa  286  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  61.79 
 
 
225 aa  285  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  62.09 
 
 
223 aa  284  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  62.33 
 
 
217 aa  284  9e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  61.79 
 
 
213 aa  281  7.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  58.02 
 
 
225 aa  279  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  56.94 
 
 
225 aa  276  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.45 
 
 
224 aa  265  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.82 
 
 
216 aa  264  7e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  55.98 
 
 
230 aa  262  3e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.14 
 
 
215 aa  260  8.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  55.02 
 
 
232 aa  255  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  53.39 
 
 
226 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  55.61 
 
 
214 aa  240  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.73 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  53.52 
 
 
213 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  54.93 
 
 
214 aa  236  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  54.5 
 
 
214 aa  234  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  54.93 
 
 
219 aa  234  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  53.99 
 
 
220 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  54.03 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  53.88 
 
 
229 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  51.6 
 
 
228 aa  232  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  53.52 
 
 
230 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  53.08 
 
 
216 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.71 
 
 
213 aa  224  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  53.08 
 
 
241 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  50.94 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.58 
 
 
213 aa  217  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  55.61 
 
 
217 aa  208  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.43 
 
 
213 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  49.52 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  48.15 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  48.82 
 
 
212 aa  188  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  44.61 
 
 
221 aa  185  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  48.34 
 
 
212 aa  185  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  46.48 
 
 
215 aa  184  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  44.61 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.19 
 
 
217 aa  181  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.19 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  45.74 
 
 
221 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  45.71 
 
 
217 aa  176  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  46.97 
 
 
208 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.78 
 
 
212 aa  174  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.24 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  37.32 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  42.93 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0864  peroxidase  44.95 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  46.15 
 
 
208 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  46.07 
 
 
212 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  43.37 
 
 
211 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  45.9 
 
 
211 aa  168  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  43.37 
 
 
211 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  41.06 
 
 
208 aa  168  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0215  Peroxidase  46.07 
 
 
213 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136957  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  44.92 
 
 
213 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  45.56 
 
 
211 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0864  Peroxidase  47.8 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.130383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  46.11 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  45.6 
 
 
212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  43.89 
 
 
209 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  45.05 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  45.05 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  47.54 
 
 
213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2963  Peroxidase  42.13 
 
 
213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  46.11 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  45.21 
 
 
210 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  42.93 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  45.99 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2859  Peroxidase  45.05 
 
 
212 aa  161  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  44.44 
 
 
212 aa  161  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2374  1-Cys peroxiredoxin  42.5 
 
 
216 aa  160  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  40.8 
 
 
261 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  43.96 
 
 
212 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.48 
 
 
213 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  44.67 
 
 
218 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  43.41 
 
 
212 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  42.86 
 
 
212 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>