More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1581 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  100 
 
 
213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  93.9 
 
 
213 aa  421  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  94.37 
 
 
213 aa  421  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  61.79 
 
 
214 aa  280  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  60.68 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  54.21 
 
 
214 aa  267  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  54.93 
 
 
213 aa  261  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  55.14 
 
 
214 aa  261  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  56.31 
 
 
216 aa  256  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  54.37 
 
 
220 aa  255  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  53.3 
 
 
223 aa  254  7e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  56.02 
 
 
217 aa  250  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  52.61 
 
 
230 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  52.86 
 
 
241 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.93 
 
 
213 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  52.44 
 
 
229 aa  240  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  51.63 
 
 
221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  51.69 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  50 
 
 
215 aa  231  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  48.58 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  50 
 
 
240 aa  229  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  53.08 
 
 
212 aa  229  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  50 
 
 
226 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  51.85 
 
 
220 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 
220 aa  224  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  50.71 
 
 
212 aa  224  9e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  52.36 
 
 
215 aa  223  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  51.89 
 
 
215 aa  222  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  50.73 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  48.62 
 
 
216 aa  218  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  50.73 
 
 
221 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  49.09 
 
 
223 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.52 
 
 
215 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  53.65 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  46.79 
 
 
232 aa  214  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  48.82 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  48.37 
 
 
225 aa  211  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  47.85 
 
 
213 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  48.82 
 
 
224 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  48.34 
 
 
221 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  47.42 
 
 
213 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.24 
 
 
215 aa  208  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  47.39 
 
 
225 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2363  peroxidase  48.5 
 
 
212 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41044  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  48.61 
 
 
230 aa  206  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  47.39 
 
 
223 aa  205  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  52.06 
 
 
209 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  51.55 
 
 
212 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  48.5 
 
 
208 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.82 
 
 
216 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  48.82 
 
 
232 aa  203  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  45.97 
 
 
225 aa  203  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.92 
 
 
224 aa  203  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  48.26 
 
 
212 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  51.03 
 
 
212 aa  202  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  50.25 
 
 
209 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  47.76 
 
 
212 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  49.25 
 
 
209 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.3 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  49.3 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  48.5 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  48 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2948  peroxidase  49 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  47.32 
 
 
261 aa  199  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  46.46 
 
 
213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  42.44 
 
 
234 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  48.26 
 
 
212 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  48.28 
 
 
256 aa  198  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  48.26 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  46.51 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  45.77 
 
 
217 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  45.77 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3162  1-Cys peroxiredoxin  47 
 
 
213 aa  195  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  54.69 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  46.77 
 
 
212 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  46.77 
 
 
212 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3905  1-Cys peroxiredoxin  45.27 
 
 
213 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  47.03 
 
 
212 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  46.63 
 
 
213 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2802  1-Cys peroxiredoxin  45.27 
 
 
212 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121304  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  46.53 
 
 
212 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  45.77 
 
 
212 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  45.27 
 
 
212 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  45.77 
 
 
212 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  46.39 
 
 
210 aa  192  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  45.27 
 
 
212 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.280469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  45.27 
 
 
212 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  46.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  45.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  45.77 
 
 
212 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  49 
 
 
208 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  46.77 
 
 
213 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  46.53 
 
 
212 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.22 
 
 
217 aa  191  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>