More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0119 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  98.6 
 
 
215 aa  436  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  73.24 
 
 
216 aa  339  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  73.49 
 
 
225 aa  339  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  70.97 
 
 
221 aa  339  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  73.46 
 
 
212 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  71.03 
 
 
215 aa  333  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  71.63 
 
 
220 aa  330  7.000000000000001e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  70.62 
 
 
212 aa  328  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  71.43 
 
 
226 aa  324  7e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  68.37 
 
 
213 aa  321  5e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  68.37 
 
 
220 aa  320  9.000000000000001e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  67.91 
 
 
213 aa  317  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  62.21 
 
 
223 aa  308  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  69.19 
 
 
217 aa  307  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  68.08 
 
 
217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  68.08 
 
 
217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  68.08 
 
 
217 aa  304  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  66.04 
 
 
215 aa  304  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  65.74 
 
 
217 aa  300  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  61.79 
 
 
224 aa  297  7e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  64.19 
 
 
215 aa  296  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  61.21 
 
 
225 aa  296  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  66.98 
 
 
213 aa  296  1e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  59.91 
 
 
225 aa  295  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  61.14 
 
 
224 aa  294  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.72 
 
 
216 aa  293  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  63.16 
 
 
221 aa  291  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  59.35 
 
 
225 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  59.81 
 
 
223 aa  291  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.62 
 
 
215 aa  289  3e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  61.4 
 
 
230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  60.47 
 
 
232 aa  281  5.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.75 
 
 
224 aa  277  7e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  54.5 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  51.89 
 
 
214 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  52.11 
 
 
214 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  52.36 
 
 
220 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  52.83 
 
 
214 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  49.55 
 
 
226 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  51.66 
 
 
213 aa  225  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  52.61 
 
 
216 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.89 
 
 
213 aa  222  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  51.89 
 
 
223 aa  221  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  50 
 
 
229 aa  221  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  49.77 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  50.93 
 
 
241 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  47.73 
 
 
240 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  52.83 
 
 
213 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  50.47 
 
 
213 aa  217  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  49.06 
 
 
230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  49.53 
 
 
217 aa  204  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  49.07 
 
 
217 aa  198  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  44.08 
 
 
232 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.45 
 
 
213 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  50.23 
 
 
212 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  46.23 
 
 
215 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  47.22 
 
 
212 aa  185  5e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  42.72 
 
 
221 aa  182  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  46.26 
 
 
217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  42.72 
 
 
221 aa  181  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  44.34 
 
 
215 aa  176  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.91 
 
 
217 aa  176  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.91 
 
 
217 aa  175  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  38.5 
 
 
234 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.37 
 
 
212 aa  168  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.82 
 
 
210 aa  167  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  40.69 
 
 
221 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  45.31 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  44.25 
 
 
208 aa  161  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  41.83 
 
 
261 aa  159  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  45.83 
 
 
212 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  44.27 
 
 
212 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  43.75 
 
 
212 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  42.19 
 
 
211 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  43.75 
 
 
212 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  43.23 
 
 
212 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  44.79 
 
 
213 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.15 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  44.27 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.15 
 
 
211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  42.11 
 
 
209 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  43.75 
 
 
212 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  44.27 
 
 
212 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  41.21 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77026  predicted protein  43.07 
 
 
256 aa  152  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.262967  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  43.23 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  42.19 
 
 
212 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  44.79 
 
 
212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  41.24 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  42.63 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  44.21 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  43.23 
 
 
212 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>